当建设工程合同被认定为无效，且合同中约定了高额逾期付款利息时，逾期付款利息的调整需依据相关法律法规及司法实践进行综合判断。以下是对此问题的详细解答：
一、合同无效对逾期付款利息的影响
建设工程合同无效，意味着合同中的条款（包括逾期付款利息条款）原则上不再具有法律约束力。然而，合同无效并不意味着违约方可以完全免除责任。根据《民法典》的相关规定，合同无效后，因该合同取得的财产应当予以返还，不能返还或没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失，各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
二、逾期付款利息的调整原则
在合同无效的情况下，逾期付款利息的调整应遵循以下原则：
以实际损失为基础：逾期付款利息的调整应以承包人因发包人逾期付款而遭受的实际损失为基准。这通常包括资金被占用的利息损失等。
兼顾合同履行情况、当事人过错程度及预期利益：在调整逾期付款利息时，应综合考虑合同的履行情况（如工程进度、已付款项等）、当事人的过错程度（如是否故意违约、违约的严重程度等）以及预期利益（如合同正常履行下承包人应获得的利润等）。
根据公平原则和诚实信用原则予以衡量：法院在调整逾期付款利息时，会遵循公平原则和诚实信用原则，确保调整结果既不过分损害违约方的利益，也不过分纵容违约行为。
三、逾期付款利息的具体调整方法
在司法实践中，逾期付款利息的调整通常参照以下标准：
参照民间借贷合同的相关规定：根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，出借人请求借款人按照合同约定利率支付利息的，人民法院应予支持，但双方约定的利率超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）四倍的除外。虽然这一规定直接针对的是民间借贷合同，但在建设工程合同无效的情况下，法院有时也会参照这一标准来调整逾期付款利息。
参照买卖合同的相关规定：根据《最高人民法院关于审理买卖合同纠纷案件适用法律问题的解释（2020修正）》，买卖合同没有约定逾期付款违约金或者该违约金的计算方法时，出卖人以买受人违约为由主张赔偿逾期付款损失的，人民法院可以违约行为发生时中国人民银行授权全国银行间同业拆借中心公布的一年期贷款市场报价利率（LPR）标准为基础，加计30-50%计算逾期付款损失。在建设工程合同无效的情况下，法院也可能参照这一标准来调整逾期付款利息。
综合考虑实际损失和过错程度：在具体案件中，法院还会综合考虑承包人的实际损失（如资金被占用的利息损失、因违约导致的额外费用等）和发包人的过错程度（如是否故意违约、违约的严重程度等）来调整逾期付款利息。
四、案例参考与司法实践
从司法实践来看，法院在调整建设工程合同无效后的逾期付款利息时，通常会根据案件的具体情况，参照上述标准进行综合判断。例如，在某些案件中，法院可能认为双方约定的违约金过高，并参照LPR的4倍或LPR加计30-50%的标准来调整逾期付款利息。
五、结论与建议
综上所述，当建设工程合同被认定为无效且合同中约定了高额逾期付款利息时，逾期付款利息的调整应遵循以实际损失为基础、兼顾合同履行情况、当事人过错程度及预期利益、根据公平原则和诚实信用原则予以衡量的原则。在具体调整时，法院可能会参照民间借贷合同或买卖合同的相关规定，并结合案件的具体情况进行综合判断。
建议：在签订建设工程合同时，双方应明确约定合理的逾期付款利息条款，并充分考虑合同无效等风险情况。在合同履行过程中，双方应严格遵守合同约定，避免违约行为的发生。一旦发生纠纷，应及时咨询专业律师，通过法律途径维护自身合法权益。