公司让员工转给自然人的业务款，若存在纠纷或违法行为，公司确实有可能起诉该自然人，但具体情况需具体分析。以下是从不同角度对此问题的详细解答：

一、从合同关系角度分析

1. 合同相对性原则：

   • 若员工转款行为是基于公司的授权或指令，且该转款行为与自然人之间形成了某种合同关系（如借款合同、买卖合同等），则公司作为合同的一方（或通过员工作为代理人），在自然人未履行合同义务时，有权依据合同关系起诉自然人。
   • 例如，若公司委托员工向自然人借款，并约定了还款期限和利息，但自然人未按期还款，公司则有权起诉自然人要求还款。

2. 无合同关系的情况：

   • 若员工转款行为并未与自然人形成明确的合同关系，而是基于其他原因（如误转、赠与等），则公司起诉自然人的法律依据可能不足。
   • 在这种情况下，公司需要证明转款行为的性质、目的以及自然人应承担的责任，这往往较为困难。

二、从侵权责任角度分析

1. 自然人存在过错：

   • 若自然人通过欺诈、胁迫等手段诱使员工转款，或自然人明知转款行为存在违法性而仍然接受，则自然人可能构成侵权，公司有权起诉自然人要求赔偿损失。
   • 例如，自然人伪造合同或文件，诱使员工向其转款，公司发现后有权起诉自然人要求返还款项并赔偿损失。

2. 自然人无过错：

   • 若自然人接受转款时并无过错（如误收、善意取得等），则公司起诉自然人的难度较大。
   • 在这种情况下，公司可能需要通过其他途径（如与员工协商、报警等）来解决问题。

三、从公司内部管理角度分析

1. 员工行为代表公司：

   • 若员工转款行为是公司授权或指令下的职务行为，则公司应承担相应的法律后果。若自然人未履行义务，公司有权以自身名义起诉自然人。
   • 但需注意，公司应确保员工转款行为的合法性和合规性，避免因员工违法行为而牵连公司。

2. 员工个人行为：

   • 若员工转款行为是个人行为，与公司无关，则公司起诉自然人的法律依据可能不足。
   • 在这种情况下，公司可能需要通过内部管理措施（如纪律处分、追偿等）来处理员工的问题。

四、法律建议与风险提示

1. 完善合同与授权文件：

   • 公司应确保与自然人之间的交易或合作有明确的合同或授权文件作为依据，以降低法律风险。

2. 加强内部管理：

   • 公司应加强对员工转款行为的监督和管理，确保员工转款行为的合法性和合规性。

3. 及时咨询与维权：

   • 若公司发现员工转款行为存在纠纷或违法行为，应及时咨询专业律师并采取相应的法律措施来维护自身权益。

若您在公司法务方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。