医院借用公司设备并收费是否合法，需分情况讨论：

1. 若存在合法有效的合同或协议：

   • 合法性：如果医院与公司之间签订了合法有效的借用合同或协议，并且合同中明确约定了设备的使用费用（即收费条款），那么这种收费行为是合法的。因为合同是双方自愿、平等、协商一致的结果，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，就具有法律效力。
   • 建议：在签订合同时，应明确设备的借用期限、使用方式、费用标准及支付方式等关键条款，以避免后续产生纠纷。

2. 若无合同或协议，或合同无效：

   • 非法性：如果医院与公司之间没有签订借用合同或协议，或者合同因违反法律、行政法规的强制性规定而无效，那么医院擅自收费就可能构成非法行为。因为此时医院没有合法的依据来收取费用，这种行为可能侵犯了公司的财产权。
   • 法律后果：公司有权要求医院返还非法收取的费用，并可能根据实际情况要求医院承担违约责任或赔偿责任。如果医院的收费行为构成欺诈或其他违法行为，还可能面临行政处罚或刑事责任。

3. 特殊情况考虑：

   • 公益性质：如果医院借用设备是用于公益目的（如紧急救援、公共卫生事件等），且双方事先有明确的约定或行业惯例支持不收费，那么医院收费可能就不合适。但这种情况需要具体分析，不能一概而论。
   • 设备性质：如果借用的设备属于特殊设备（如医疗设备、科研设备等），其使用和管理可能受到更严格的监管。此时，医院收费是否合法还需考虑相关法规的规定。

法律背景与建议：

• 在处理此类问题时，应首先审查双方是否存在合法有效的合同或协议，以及合同中的相关条款。
• 如果合同存在且合法有效，应按照合同约定执行；如果合同不存在或无效，则应根据实际情况和法律规定来判断收费行为的合法性。
• 为避免纠纷，建议医院和公司在借用设备前签订详细的借用合同或协议，并明确双方的权利和义务。

可能产生的法律后果：

• 如果医院收费行为被认定为非法，公司有权要求医院返还费用并承担相应责任。
• 如果医院的收费行为构成欺诈或其他违法行为，还可能面临更严重的法律后果。

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