结论：在A处购买商品但由B开具发票的行为是否违法，需结合具体情形判断，可能涉及违法也可能合法。以下分情况说明：
1. 若A与B存在合法关联关系，且符合税务规定，则不违法
- 合法情形：若A与B属于同一集团、关联企业或存在合法委托关系（如A委托B代为开具发票，且B具备代开权限），且发票内容与实际交易一致（商品名称、数量、金额等），则该行为不违法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务或从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。若B作为收款方或经授权的代开方，可合法开具发票。
2. 若A与B无合法关联，或发票内容与实际交易不符，则可能违法
- 违法情形：
- 虚开发票：若B未实际参与交易（如无商品销售或服务提供），仅为A“代开”发票，或发票内容与实际交易不符（如金额、商品名称虚假），则构成虚开发票行为。
- 偷逃税款：若A通过B开具发票隐瞒收入、虚增成本，导致国家税款流失，可能涉及逃税罪。
- 法律后果：
- 根据《发票管理办法》第三十五条，虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
- 根据《刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，最高可处无期徒刑，并处罚金或没收财产。
3. 特殊情形：第三方平台或代开发票服务
- 合法代开：若通过税务机关指定的第三方平台（如电子税务局）代开发票，且符合代开条件（如个人临时经营需代开发票），则属于合法行为。
- 非法代开：若通过非正规渠道（如“票贩子”）购买发票，或代开方无代开权限，则属于违法行为。
建议
- 核实交易主体：确认A与B是否存在合法关联或委托关系。
- 核对发票内容：确保发票与实际交易一致（商品、金额、付款方等）。
- 避免虚开行为：切勿为“少缴税”或“套取费用”虚开发票。
- 咨询税务机关：对代开发票的合法性存疑时，可向当地税务机关核实。
如有具体交易场景或发票样本，可进一步提供细节，我将为您分析合法性及风险。