两个药品申办者之间必须权利义务约定明确。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律原则与合同精神
合同自由原则：根据合同法的相关规定，合同双方有权在平等、自愿的基础上，就合同的内容进行协商并达成一致。这意味着，两个药品申办者作为合同双方，有权并应当就各自的权利和义务进行明确约定。
合同明确性要求：合同是双方行为准则的书面体现，其内容应当具体、明确，以便双方能够准确理解和执行。如果权利义务约定不明确，可能导致合同履行过程中的争议和纠纷，甚至影响合同的法律效力。
二、药品申办者的特殊性与风险防控
药品申办的特殊性：药品申办涉及复杂的研发、审批、生产、销售等环节，每个环节都可能存在风险和不确定性。因此，两个药品申办者之间必须就各自在研发、审批、生产、销售等环节中的权利和义务进行明确约定，以规避潜在的风险。
风险防控的需要：明确的权利义务约定有助于双方在合同履行过程中及时识别和应对风险，减少因权利义务不清而导致的纠纷和损失。例如，如果一方未按照约定履行其义务，另一方可以依据合同条款要求其承担违约责任。
三、实践案例与法律后果
实践案例：在实际操作中，因权利义务约定不明确而导致的合同纠纷并不少见。例如，在某些药品合作研发项目中，由于双方未就研发成果的归属、使用、收益等关键问题达成明确约定，导致在项目后期出现争议和纠纷。
法律后果：如果两个药品申办者之间的合同权利义务约定不明确，一旦发生纠纷，法院或仲裁机构可能难以根据合同条款作出公正、合理的裁决。这不仅会损害双方的合法权益，还可能影响药品申办的顺利进行。
四、建议与措施
明确约定权利义务：在签订合同时，两个药品申办者应当就各自在研发、审批、生产、销售等环节中的权利和义务进行详细、明确的约定。这包括但不限于研发成果的归属、使用、收益分配、违约责任等关键问题。
寻求专业法律意见：在签订合同前，双方可以寻求专业律师的法律意见，以确保合同条款的合法性和有效性。律师可以根据双方的实际情况和需求，提供针对性的法律建议和解决方案。
定期审查与更新合同：随着药品申办项目的进展和市场环境的变化，双方应当定期审查并更新合同条款，以确保其始终符合双方的实际情况和需求。
如有任何关于药品申办合同或合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况和需求，提供针对性的法律建议和解决方案。