核心结论：员工未做满1个月自动离职，用人单位可依据劳动合同、规章制度及法律规定主张权利，具体处理需结合离职原因、合同约定及实际损失综合判断。以下分情况说明：

1. 员工无合法理由擅自离职

• 法律后果：根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前30日（试用期3日）书面通知方可解除合同。未履行通知义务擅自离职的，属于违法解除劳动合同。
• 用人单位权利：
  • 要求赔偿损失：若员工离职导致用人单位产生直接经济损失（如招聘费用、培训成本、项目延误损失等），可依据《劳动合同法》第九十条要求赔偿，但需举证损失与离职行为的因果关系。
  • 扣减工资限制：根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可从工资中扣除赔偿费用，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
• 操作建议：
  • 保留员工擅自离职的证据（如考勤记录、工作交接记录、通知返岗记录等）。
  • 通过书面形式（如律师函）要求员工返岗或赔偿损失，避免口头沟通无凭证。

2. 员工因用人单位过错离职（如未及时支付工资、未缴社保等）

• 法律后果：根据《劳动合同法》第三十八条，用人单位存在过错时，劳动者可立即解除合同并主张经济补偿。
• 用人单位风险：
  • 需支付经济补偿：员工以用人单位过错为由离职的，可要求支付半个月工资作为经济补偿（工作不满6个月按0.5个月计算）。
  • 无法主张赔偿：若员工离职系因用人单位违法在先，用人单位无权要求员工赔偿损失。
• 操作建议：
  • 立即自查是否存在未及时支付工资、未缴社保、未提供劳动条件等违法行为。
  • 若存在过错，建议与员工协商补发工资或补缴社保，避免员工申请劳动仲裁。

3. 员工未签订劳动合同即离职

• 法律后果：根据《劳动合同法》第十条，用人单位自用工之日起1个月内未签订书面劳动合同的，需支付双倍工资（自用工次月起计算）。
• 用人单位风险：
  • 双倍工资赔偿：若员工工作不满1个月即离职，但用人单位未在1个月内补签合同，需支付从用工次日起至离职日的双倍工资差额（实际工作天数×日工资×1倍）。
  • 事实劳动关系认定：即使未签合同，员工仍可主张存在事实劳动关系，要求支付工资及赔偿。
• 操作建议：
  • 立即补签书面劳动合同（注明补签日期），避免双倍工资风险。
  • 保留工资支付记录、考勤记录等证明劳动关系的证据。

综合建议

1. 完善规章制度：在员工手册中明确擅自离职的赔偿责任及扣款规则，并经民主程序公示。
2. 及时沟通处理：发现员工擅自离职后，立即通过书面形式（如EMS）通知其返岗或办理离职手续，避免扩大损失。
3. 法律程序保障：若协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张工资、赔偿金或经济补偿。

提示：劳动争议处理需严格遵循时效规定（劳动仲裁时效为1年），建议用人单位在发生争议后尽快处理。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。