赔偿3倍运费的运费是按照规定价格计算。以下是对这一结论的详细分析：

一. 赔偿3倍运费的法律依据

1. 《中华人民共和国消费者权益保护法》第五十五条：如果经营者提供商品或者服务存在欺诈行为，应当按照消费者的要求增加赔偿其受到的损失，增加赔偿的金额为消费者购买商品的价款或者接受服务的费用的三倍。这一规定适用于经营者在提供商品或服务过程中的欺诈行为，与运费价格无关。

2. 《中华人民共和国邮政法》第四十七条：未保价的给据邮件丢失、损毁或者内件短少的，邮政企业应当按照实际损失进行赔偿，但最高赔偿额不超过所收取资费的三倍。这一规定适用于邮政企业提供的邮政普遍服务，与商家合作的价格无直接关联。

二. 赔偿3倍运费的计算方式

1. 按照规定价格计算：在赔偿3倍运费的情境下，运费是按照邮政企业或快递服务提供者所规定的价格来计算的，而不是按照商家合作的价格。这是因为赔偿标准是由服务提供者制定的，并受到相关法律法规的约束。

2. 与商家合作价格无关：商家合作的价格可能涉及折扣、优惠等因素，但这些因素在赔偿计算中通常不被考虑。赔偿3倍运费的目的是对消费者的损失进行补偿，而不是基于商家合作价格进行调整。

三. 实际案例与操作

• 在实际操作中，当快件发生丢失、损毁或延误等情形时，消费者有权要求服务提供者按照约定或法律规定进行赔偿。赔偿金额的计算依据是服务提供者所规定的运费价格，而非商家合作价格。

• 例如，如果一件快件的运费是100元，且该快件在运输过程中丢失，那么根据《中华人民共和国邮政法》第四十七条的规定，服务提供者最多需要赔偿300元（即运费的3倍），而不是按照商家合作的可能更低的价格来计算赔偿金额。

我的观点：赔偿3倍运费的运费是按照规定价格计算，与商家合作的价格无关。这是基于相关法律法规的明确规定和服务提供者所制定的赔偿标准。消费者在遭遇此类情况时，应明确自己的权益，并依法要求赔偿。如有进一步需要，您可以继续咨询我。