在货物买卖合同纠纷中，三倍赔偿通常是按照商品的实际价值来计算，而非付款金额。以下是对这一问题的详细分析：

一、三倍赔偿的法律依据与适用范围

根据《中华人民共和国消费者权益保护法》第五十五条的规定，经营者提供商品或者服务有欺诈行为的，应当按照消费者的要求增加赔偿其受到的损失，增加赔偿的金额为消费者购买商品的价款或者接受服务的费用的三倍；增加赔偿的金额不足五百元的，为五百元。这一条款明确规定了三倍赔偿的适用范围和计算方式，即针对的是经营者欺诈行为导致的消费者损失，赔偿金额以购买商品的价款或接受服务的费用为基数进行计算。

二、三倍赔偿的计算基数

1. 商品价值：在货物买卖合同中，商品价值通常指的是商品的市场价格或交易价格，即消费者实际支付的金额。这是三倍赔偿计算的主要基数。
2. 付款金额：付款金额是消费者实际支付给经营者的金额，它通常与商品价值相等，但在某些情况下（如折扣、优惠等）可能有所不同。然而，在计算三倍赔偿时，我们关注的是商品的实际价值，而非消费者实际支付的金额（除非两者完全一致且没有欺诈行为导致的价格差异）。但在欺诈行为的认定下，若经营者通过欺诈手段使消费者支付了高于商品实际价值的金额，那么赔偿基数应当是消费者实际支付的金额（即欺诈行为导致的实际损失），不过从法律条文表述“购买商品的价款”来看，更侧重于商品本身的交易价格，在欺诈场景下此交易价格因欺诈而虚高，实际仍是以该虚高的交易价格（也即消费者以为的商品价值、实际支付的对应商品部分价款）为基准来算三倍赔偿，而非纯粹以商品真实价值（若消费者不知真实价值且因欺诈支付了更高价时）。但总体原则是围绕因欺诈涉及的商品交易相关价款来确定赔偿基数，核心是商品交易情境下的价款，而非脱离商品交易单纯看付款这个动作的金额（比如消费者预付款但还未实际交易商品，此时因经营者欺诈要三倍赔偿，就不是按预付款全额算，而是看与欺诈相关的商品交易部分价款）。不过在常见的已实际完成商品买卖且存在欺诈的情形下，可以理解为按商品交易时的实际成交价（即商品价值在交易中的体现金额）来算三倍赔偿。

三、实际应用中的注意事项

1. 欺诈行为的认定：三倍赔偿的前提是经营者存在欺诈行为。欺诈行为通常指的是经营者故意隐瞒商品的真实情况或提供虚假信息，导致消费者做出错误的购买决策。
2. 赔偿金额的确定：在确定赔偿金额时，除了考虑商品价值或付款金额外，还需要考虑消费者因欺诈行为受到的实际损失。如果三倍赔偿金额不足以弥补消费者的实际损失，消费者还可以要求经营者承担其他赔偿责任。
3. 举证责任：在货物买卖合同纠纷中，消费者需要承担举证责任，证明经营者存在欺诈行为以及自己因欺诈行为受到的损失。因此，消费者在购买商品时应保留好相关证据，如购物发票、商品说明书、广告宣传资料等。

四、举例说明

假设消费者在某商场购买了一台标价为5000元的电视机，但后来发现该电视机存在质量问题且商场在销售过程中存在欺诈行为（如虚假宣传、隐瞒商品缺陷等）。在这种情况下，消费者可以要求商场按照《消费者权益保护法》的规定进行三倍赔偿，即赔偿金额为5000元（商品价值）的三倍，共计15000元。如果消费者实际支付的金额低于5000元（如因折扣、优惠等原因），但商场的欺诈行为导致消费者以为该电视机价值5000元并据此做出购买决策，那么赔偿基数仍可能是基于该欺诈情境下消费者认知的商品交易价款（接近或等于5000元这个标价体现的商品价值对应交易金额）来算三倍赔偿，具体需结合实际情况和证据认定。

综上所述，在货物买卖合同纠纷中，三倍赔偿通常是按照商品的实际价值（即交易时的成交价，体现商品价值）来计算。如果你在货物买卖合同中遇到了相关纠纷或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。