在著作权侵权案中，违法所得是否退还并不直接影响是否起诉的决定，但退还情况可能作为量刑或赔偿的考量因素。是否起诉主要取决于侵权行为的性质、证据充分性以及法律规定的起诉条件。
一、违法所得退还与起诉的关系
违法所得退还的性质：
- 违法所得退还通常是侵权人承认错误、积极赔偿的一种表现，但这并不意味着可以免除法律责任。退还违法所得更多是在量刑或民事赔偿阶段考虑的因素，而非决定是否起诉的关键。
起诉的决定因素：
- 是否起诉主要取决于侵权行为的性质是否构成犯罪或民事侵权，以及是否有足够的证据支持起诉。如果侵权行为明确，且证据充分，即使违法所得已经退还，检察机关或权利人仍可能选择起诉。
二、不起诉的可能情况
情节显著轻微：
- 如果侵权行为情节显著轻微，危害不大，根据《刑事诉讼法》的相关规定，可能不认为是犯罪，从而不起诉。但这需要具体案件具体分析，不能一概而论。
证据不足：
- 如果证据不足以证明侵权行为的存在或侵权人的责任，检察机关可能因证据不足而决定不起诉。
和解或撤诉：
- 在民事侵权案件中，如果双方达成和解，权利人可能选择撤诉。但这并不意味着侵权人免除了法律责任，只是权利人选择了不再追究。
三、法律建议
积极应对：
- 如果面临著作权侵权指控，无论违法所得是否退还，都应积极应对，配合调查，提供相关证据和材料。
寻求法律帮助：
- 在处理著作权侵权案件时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保护。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助应对复杂的法律问题。
了解法律后果：
- 在决定是否起诉或应对起诉时，应充分了解法律后果，包括可能的刑事处罚、民事赔偿等。这有助于做出更明智的决策。
如果有任何关于著作权侵权或其他知识产权领域的法律问题，可以直接向我咨询。