行政诉讼中，申请撤诉与按撤诉处理在行为性质、法律后果及适用条件上均存在显著差异，以下从这三个方面进行详细阐述：
一、行为性质
申请撤诉：
- 定义：申请撤诉是原告在法院立案受理后、进行宣判前，以书面或口头形式向人民法院提出撤回其起诉的要求。
- 性质：这是一种主动的诉讼行为，体现了原告对其诉讼权利的处分权。原告有权决定是否继续进行诉讼，这是法律赋予其的一项基本权利。
按撤诉处理：
- 定义：按撤诉处理是指原告虽然没有提出撤诉申请，但其在诉讼中的一定行为已经表明他不愿意继续进行民事诉讼（在行政诉讼中同样适用），因而法院依法决定注销案件不予审理的行为。
- 性质：这是一种被动的诉讼处理方式，通常发生在原告未明确表示撤诉意愿，但其行为已实质上表明放弃诉讼的情况下。
二、法律后果
申请撤诉：
- 后果：若申请撤诉符合法定条件，人民法院应当裁定准许撤诉。撤诉后，原告通常可以就同一事实和理由再次起诉（但需注意诉讼时效等问题）。
- 例外：若申请撤诉不符合法定条件，或者被告改变被诉具体行政行为后当事人不撤诉的，人民法院应当及时作出裁判。
按撤诉处理：
- 后果：一旦法院决定按撤诉处理，案件即被注销，不再进行审理。这意味着原告失去了通过该次诉讼解决争议的机会。
- 影响：与申请撤诉不同，按撤诉处理通常不涉及原告再次起诉的权利问题，因为案件已被法院主动注销。但若原告认为有新的事实或理由，仍可依法另行起诉。
三、适用条件
申请撤诉：
- 条件：根据《最高人民法院关于行政诉讼撤诉若干问题的规定》，原告申请撤诉需符合以下条件：
- 申请撤诉是当事人真实意思表示；
- 被告改变被诉具体行政行为，不违反法律、法规的禁止性规定，不超越或者放弃职权，不损害公共利益和他人合法权益；
- 被告已经改变或者决定改变被诉具体行政行为，并书面告知人民法院；
- 第三人无异议。
按撤诉处理：
- 条件：按撤诉处理通常发生在原告未明确表示撤诉意愿，但其行为已实质上表明放弃诉讼的情况下。例如，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按照撤诉处理。
法律建议：
- 对于原告而言，若希望结束诉讼程序，应明确表达撤诉意愿，并符合法定条件，以避免被法院按撤诉处理。
- 对于被告而言，应关注原告的行为动态，及时与法院沟通，确保诉讼程序的顺利进行。
- 在任何情况下，当事人都应遵守诉讼程序规定，尊重法院的裁判权，以维护诉讼的公正性和效率性。
可能法律后果：若原告未明确表达撤诉意愿，且其行为已实质上表明放弃诉讼，法院可能依法决定按撤诉处理，导致原告失去通过该次诉讼解决争议的机会。因此，当事人在诉讼过程中应谨慎行事，确保自身权益得到有效维护。