结论：在诈骗罪案件中，若犯罪嫌疑人在公安机关取保候审期间获得了对方的谅解书，但案件到了检察院阶段被认为证据不足，司法机关会按照法定程序处理，具体结果取决于证据的充分性和案件的具体情况。
分析如下：
公安机关阶段：
- 若公安机关在侦查过程中发现证据不足，可能会进行补充侦查。根据法律规定，补充侦查的次数以两次为限，每次期限约为一个月。
- 如果经过两次补充侦查后，公安机关仍然认为证据不足，不符合起诉条件，那么公安机关可能会作出不起诉的决定，或者将案件移送检察院审查起诉时注明证据情况。
检察院审查起诉阶段：
- 检察院在审查起诉时，如果认为证据不足，可以将案件退回公安机关补充侦查，或者自行进行侦查。
- 如果经过补充侦查后，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件，那么检察院应当作出不起诉的决定。此时，谅解书虽然可能作为量刑情节考虑，但不足以弥补证据的不足。
审判阶段：
- 如果案件进入审判阶段，法院在审理时认为证据不足以认定被告人有罪，那么法院应当作出证据不足、指控犯罪不能成立的无罪判决。
- 在这种情况下，无论被告人是否获得了对方的谅解书，都不能改变证据不足的事实，因此被告人可能因证据不充分而不被追究刑事责任。
法律建议：
- 对于犯罪嫌疑人而言，获得对方的谅解书是一个积极的因素，可能在一定程度上影响量刑。然而，在证据不足的情况下，谅解书并不能直接导致不起诉或无罪判决。
- 如果案件到了检察院阶段被认为证据不足，犯罪嫌疑人及其辩护律师应当积极与检察院沟通，了解证据的具体情况，并考虑是否需要进一步补充证据或提出其他辩护意见。
- 同时，犯罪嫌疑人及其家属也应当做好心理准备，接受司法机关按照法定程序作出的决定。
可能的法律后果：
- 如果证据确实不足，不符合起诉条件，那么犯罪嫌疑人可能不会被追究刑事责任。
- 如果后续发现了新的证据，或者原有证据得到了进一步的补强，那么案件可能会重新进入司法程序。
举例说明：
假设某犯罪嫌疑人因涉嫌诈骗被公安机关取保候审，并获得了对方的谅解书。然而，在侦查过程中，公安机关发现证据不足，进行了两次补充侦查后仍然认为证据不充分。案件移送检察院审查起诉后，检察院也认为证据不足，作出了不起诉的决定。在这种情况下，犯罪嫌疑人虽然获得了对方的谅解书，但由于证据不足，仍然不会被追究刑事责任。
总之，在处理此类案件时，建议犯罪嫌疑人及其家属积极与司法机关沟通，了解案件进展和证据情况，并考虑是否需要寻求专业律师的帮助以维护自身合法权益。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。