合同履行三年后是否有效，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合同约定履行期三年且无特别约定

• 若合同明确约定了履行期限为三年，且没有附条件或附期限的特别约定，那么在三年期满后，合同的权利义务通常终止，合同不再具有效力。这是因为合同履行期限是合同双方约定的权利义务存续的时间范围，期满即意味着双方约定的义务已经完成或应当完成，合同自然终止。

2. 合同附条件或附期限

• 附解除条件：如果合同附有解除条件，且该条件在三年期满时尚未成就，那么即使合同已经履行了三年，合同仍然继续有效。例如，双方约定合同在三年期满后，若满足某一特定条件（如某项目成功完成）则解除，那么在该条件未成就前，合同继续有效。
• 附生效期限：如果合同附有生效期限，且该期限在三年期满后才到来，那么合同在三年期满时并未生效，而是在期限到来时才生效。这种情况下，合同履行三年后仍然可能处于未生效状态。

3. 合同期满后继续履行

• 如果在合同期满后，一方继续履行主要义务，且对方接受，那么原合同继续有效，但变为不定期合同。这意味着双方没有重新签订合同，但按照原合同的条款继续履行义务，形成了一种事实上的合同关系。例如，租赁合同期满后，承租人继续支付租金，出租人继续提供租赁物，双方未提出异议，则租赁合同继续有效，但变为不定期租赁。

4. 合同效力与诉讼时效的区别

• 需要注意的是，合同的效力与诉讼时效是两个不同的概念。合同的效力是指合同是否具有法律约束力，而诉讼时效是指权利人在法定期间内不行使权利，即丧失请求法院依法保护其权利的权利。即使合同超过了三年仍在履行，只要合同本身不存在无效情形（如违反法律法规强制性规定、欺诈胁迫等），就不影响其效力。但是，如果因合同纠纷需要通过诉讼解决，且超过了诉讼时效期间，对方以诉讼时效抗辩，法院可能会驳回原告诉讼请求（存在诉讼时效中断、中止等特殊情况除外）。

法律建议

• 审查合同条款：在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于履行期限、附条件或附期限的约定，以确保自己的权益得到充分保障。
• 及时行使权利：如果合同期满后需要继续履行或存在其他争议，应及时与对方协商解决，或依法向法院提起诉讼，避免超过诉讼时效期间而丧失胜诉权。
• 寻求专业帮助：如果对合同的效力或履行存在疑问，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到妥善维护。

举例说明：

假设甲公司与乙公司签订了一份为期三年的供货合同。三年期满后，甲公司认为合同已经到期失去效力，不再向乙公司供货。然而，乙公司却称合同依然有效，要求甲公司继续供货。原来，该合同虽然约定期限为三年，但附有解除条件，即“若三年内乙公司未完成特定销售目标，则合同自动续期一年”。目前，乙公司尚未完成该销售目标，因此合同仍然有效。在这种情况下，甲公司应当继续履行合同义务，否则可能构成违约。

综上所述，合同履行三年后是否有效需根据具体情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。