核心结论：农业农村局发现林地违建时，会依法启动调查、责令整改、实施处罚，甚至申请强制执行，违建方需承担法律责任。以下是具体分析：

1. 农业农村局的法定职责与调查程序

根据《森林法》《土地管理法》及《行政处罚法》，农业农村局（或其联合林业部门）对林地违建具有法定管辖权。发现违建后，其处理流程通常为：

• 现场勘查：核实违建位置、面积、用途，确认是否占用林地保护规划范围；
• 证据固定：通过拍照、测绘、询问当事人等方式固定违法事实；
• 法律适用：根据《森林法》第七十三条（擅自改变林地用途）或第七十四条（毁坏林地）认定违法行为。

关键点：农业农村局需在调查中明确违建是否涉及“基本农田”与“林地”的交叉问题（如“林耕互换”地块），避免法律适用错误。

2. 违建方的法律责任与整改要求

若违建被认定，违建方需承担：

• 行政责任：
  • 限期拆除：根据《森林法》第七十三条，农业农村局可责令限期恢复植被和林业生产条件，逾期不拆的，由林业主管部门代为拆除，费用由违建方承担；
  • 罚款：按毁坏林地面积处恢复植被和林业生产条件所需费用三倍以下的罚款（如毁坏1亩林地，罚款可能达数万元）；
• 刑事责任：若违建导致林地毁坏面积达10亩以上，可能触犯《刑法》第三百四十二条（非法占用农用地罪），处五年以下有期徒刑或拘役。

建议：违建方应在收到《责令改正通知书》后立即停止施工，主动与农业农村局协商整改方案，避免罚款叠加或刑事追责。

3. 违建方的权利救济途径

若对处罚决定不服，违建方可依法维权：

• 行政复议：自收到处罚决定书之日起60日内，向上一级农业农村部门或本级人民政府申请复议；
• 行政诉讼：自收到处罚决定书之日起6个月内，直接向人民法院起诉，主张处罚程序违法（如未告知听证权利）或事实认定错误（如误判林地性质）。

风险提示：复议或诉讼期间，处罚决定一般不停止执行，违建方需提前评估风险，必要时申请暂缓执行。

4. 特殊情形处理

• 历史遗留问题：若违建形成于2019年《森林法》修订前，可能适用原《森林法实施条例》第四十三条，处罚力度相对较轻；
• 公益林违建：若违建涉及国家级公益林，除行政处罚外，还可能被要求补种树木，并承担生态修复费用。

总结：林地违建的法律后果严重，建议违建方优先通过整改降低损失。如有具体案件细节（如违建面积、林地等级、处罚文书内容），可进一步提供，我将为您分析应对策略。