村民代表无权单方面否定合同边界条款，但可通过法定程序推动修改或撤销。具体分析如下：

1. 合同效力层面
   合同边界条款若经双方平等协商、自愿签署且内容合法（如不违反土地管理法、民法典等强制性规定），则对双方具有法律约束力。村民代表作为集体一方代理人，若未在签约时提出异议，事后单方面否定可能构成违约，需承担继续履行、赔偿损失等责任。

2. 集体决策程序层面
   若合同涉及集体土地或重大利益，根据《村民委员会组织法》第24条，需经村民会议或村民代表会议三分之二以上成员同意方可修改或撤销。村民代表个人或少数成员无权单独决定，必须通过法定表决程序形成集体意志。

3. 例外情形：条款违法或显失公平
   若边界条款存在以下情形，村民代表可主张无效或申请撤销：

   • 违反法律强制性规定（如占用基本农田）；
     
   • 签约时存在欺诈、胁迫、乘人之危；
     
   • 条款显失公平（如补偿标准远低于市场价）。
     此时需通过法院或仲裁机构确认条款效力，而非由村民代表自行否定。

建议行动步骤：

1. 核查合同签署程序是否合法（如是否经村民会议授权）；
   
2. 收集证据证明条款违法或显失公平（如土地权属证明、市场评估报告）；
   
3. 依法定程序召开村民会议表决修改方案；
   
4. 若协商无果，可向乡镇政府申请调解或直接起诉。
   

如有具体合同文本或争议细节，可进一步提供，我将为您分析条款合法性及维权路径。