生效判决确认的出资金额在工商登记中未显示，不影响股东实际出资的认定，但可能影响公司对外承担债务的能力及股东对外的责任。
一. 股东实际出资的认定
核心证据：根据公司法的规定，作为股东，要想证明自己已实际出资，最核心的证据就是银行转账凭证。对于货币出资的股东，银行转账凭证是证明出资情况的最直接证据。因此，若股东已依法将投资款实际以投资款或者出资打入投资公司的对公账户，那么就已依法完成了履行实际出资到位的义务。
其他证据：除了银行转账凭证，出资证明书也是股东证明自己已经出资的最直接方式。根据《公司法》第五十五条规定，有限责任公司成立后，应当向股东签发出资证明书。出资证明书应详细载明公司名称、公司成立日期、公司注册资本、股东的姓名或者名称、认缴和实缴的出资额、出资方式和出资日期以及出资证明书的编号和核发日期，并由法定代表人签名和加盖公司盖章。此外，企业年度报告、股东会决议、公司的会计记录和财务报表等文件，也可以作为辅助证据来证明股东的出资情况。
二. 工商登记未显示出资的影响
公司内部影响：工商登记未显示股东的实际出资，可能会引发股东之间的权益纠纷。但根据法律规定，在公司内部，如果实际出资比例与工商登记不一致，一般以实际出资比例为准进行权益分配。
公司外部影响：工商登记是对外公示的，具有对外效力。当公司与外部第三人发生冲突时，外部第三人通常会依据工商登记的信息来判断公司的实际情况。如果实缴股资未在工商登记中体现，债权人可能无法准确了解公司的实际资本情况，从而增加了他们的风险。在法律实践中，如果公司股东未按照公司章程规定实缴出资，且这种情况未在工商登记中反映出来，当公司面临债务纠纷时，债权人可能会主张股东在未实缴出资的范围内对公司债务承担连带责任。
三. 处理建议
及时更正工商登记：如果实际出资与工商登记不一致，公司应及时申请更正，以确保登记信息的准确性。这有助于维护公司的信誉和商业活动，避免不必要的法律风险。
保存相关证据：股东应妥善保存银行转账凭证、出资证明书等相关证据，以证明自己已实际出资。这些证据在涉及股东权益纠纷或公司债务纠纷时，将起到至关重要的作用。
我的观点：生效判决确认的出资金额是股东实际出资的有力证明，即使工商登记中未显示出资，也不影响股东实际出资的认定。但为了保护公司和股东的利益，建议公司及时更正工商登记信息，并妥善保存相关证据。如有进一步需要，您可以继续咨询我。