自来水公司收取每日0.5%的违约金是否合法，需结合合同约定与法律规定综合判断，具体分析如下：

1. 合同约定优先：若合同明确约定违约金条款，则合法

根据《民法典》第五百八十五条，当事人可约定一方违约时支付违约金。若用户与自来水公司签订的《供用水合同》中明确约定“逾期未交水费，每日按未交金额的0.5%支付违约金”，则该条款具有法律效力。
案例参考：乐山市自来水公司曾依据合同第7条第二款，对逾期缴费用户收取每日0.5%的违约金，法院认定该条款合法有效（乐山市案例，2024年）。

2. 违约金过高可请求调整：若约定显失公平，法院可能调减

若违约金明显高于实际损失（如自来水公司未因逾期缴费产生额外成本），用户可依据《民法典》第五百八十五条第二款，请求法院或仲裁机构调减违约金。
判断标准：

• 违约金是否超过实际损失的30%（司法实践中常见标准）；
  
• 自来水公司是否因逾期缴费产生额外费用（如催缴成本、利息损失等）。
  示例：若用户仅逾期100元水费，违约金累计达50元（每日0.5%，100天后），可能被认定为过高。

3. 未约定违约金时：按实际损失赔偿

若合同未约定违约金，自来水公司仅能主张实际损失（如逾期期间的资金占用利息）。根据《民法典》第五百七十七条，违约方需赔偿因违约造成的损失，但不得超过违约方订立合同时预见到或应当预见到的损失。
计算方式：
实际损失 = 逾期金额 × 同期LPR（贷款市场报价利率）× 逾期天数。
示例：逾期100元，LPR为3.85%，逾期30天，实际损失约0.32元（100×3.85%÷365×30）。

4. 程序合法性：自来水公司需履行提示义务

根据《民法典》第四百九十六条，格式条款提供方（如自来水公司）需以显著方式提示对方注意违约金条款。若未履行提示义务，用户可主张该条款不成为合同内容。
建议：用户可检查合同是否以加粗、下划线等方式标注违约金条款，或是否在签约时被明确告知。

法律建议

1. 核查合同：确认合同中是否约定违约金条款及具体比例；
   
2. 计算实际损失：对比违约金与实际损失，判断是否合理；
   
3. 协商或诉讼：若认为违约金过高，可与自来水公司协商调减，或通过法院、仲裁机构主张权利；
   
4. 保留证据：保存缴费记录、合同文本、催缴通知等材料，以备维权之需。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业分析。