针对您提出的“项目多上班迟到罚款是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，员工迟到虽然并不直接构成法律层面上的违法行为，但它确实违反了劳动纪律。企业为了维护正常的生产秩序和工作效率，通常会根据自身情况制定内部规章制度，其中就可能包括对员工迟到的处罚措施。

然而，这些处罚措施必须建立在合法合规的基础上。具体来说，企业要有明确的规章制度，并且这些规章制度需要经过民主程序制定，比如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定等。同时，这些规章制度还需要向劳动者进行公示，确保员工知晓并同意。

在处罚方式上，企业所采取的“罚款”实际上并非真正意义上的罚款操作，而更多地表现为扣除员工薪资。但这种扣除薪资的方式也必须合法合规，不能超过当月工资总额的20%，并且扣除后的工资仍然需要确保不低于国家规定的最低工资标准。

如果企业没有明确的规章制度，或者规章制度中的罚款条款不合法、不合理，那么对员工实施的处罚就可能缺乏依据，甚至涉嫌违法。在这种情况下，员工有权拒绝支付不合理的罚款，并可以向劳动监察部门投诉。

因此，对于“项目多上班迟到罚款是否合法”的问题，我们不能一概而论。而是需要根据企业的具体规章制度、处罚方式以及是否遵循了相关法律法规来进行综合判断。如果企业的规章制度合法合规，且处罚方式也符合法律规定，那么对员工迟到的罚款就是合法的。反之，则可能涉嫌违法。

总的来说，企业在处理员工迟到问题时，一定要遵循相关的法规制度，确保处罚措施的合法性和合理性。同时，员工也应该了解自己的权益，对于不合理的处罚有权提出异议并维护自己的合法权益。