国有企业职工迟到扣工资是否合法，主要取决于企业规章制度的制定程序是否合法、扣工资额度是否合理，以及是否存在特殊情况等因素。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律依据与规章制度
《中华人民共和国劳动法》：该法规定用人单位不得无故克扣劳动者的工资，但并未明确禁止因劳动者违规行为（如迟到）导致的合理罚款。这意味着，如果迟到行为违反了企业规章制度，且该规章制度合法有效，企业有权在合理范围内对迟到员工进行罚款。
企业规章制度：企业规章制度是企业管理的重要依据，包括对迟到等违规行为的处罚措施。然而，这些规章制度必须通过民主程序制定，即经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。同时，规章制度制定后，应向员工公示或告知，确保员工知晓并同意相关规定。
二、扣工资的合理性
扣罚金额：扣罚金额应合理，不能过高。根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
特殊情况：若员工因不可抗力等合理原因导致迟到，企业应考虑实际情况，避免盲目扣工资。例如，员工因突发疾病、交通事故等不可抗力因素导致迟到，企业应给予一定的理解和宽容。
三、实际操作建议
完善规章制度：国有企业应制定完善的规章制度，明确工作时间、迟到扣罚措施等内容，并确保规章制度的制定程序合法、内容合理。同时，规章制度应向员工公示或告知，确保员工了解并同意相关规定。
合理执行：在执行迟到扣工资时，企业应遵循公平、公正的原则，根据迟到情况合理扣款。避免过度处罚影响员工的工作积极性和满意度。例如，对于偶尔迟到的员工，可以采取警告、口头批评等方式进行教育；对于频繁迟到的员工，再考虑进行罚款等处罚措施。
员工维权途径：若员工认为企业的迟到扣工资行为不合法或存在争议，可与用人单位协商解决；协商不成的，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
四、可能存在的法律后果
若企业规章制度不合法或未公示：则企业依据该规章制度对迟到员工进行罚款的行为可能被认定为违法，员工有权要求企业返还被扣的工资，并可能获得相应的经济补偿。
若扣罚金额过高或违反最低工资标准：则企业可能面临劳动行政部门的处罚，包括责令支付足额工资、经济补偿等。同时，员工也有权向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁或向人民法院提起诉讼来维护自己的合法权益。
总结来说，国有企业职工迟到扣工资是否合法，取决于企业规章制度的制定程序是否合法、扣工资额度是否合理以及是否存在特殊情况等因素。企业在制定和执行相关规章制度时，应严格遵守法律法规的要求，确保劳动者的合法权益得到充分保障。如果您在国有企业工作且遇到迟到扣工资的问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。