关于交通肇事案件中哪些情况一定要公诉的问题，这主要取决于交通肇事行为是否构成交通肇事罪。若构成犯罪，则案件将由检察院代表国家提起公诉。以下是对此问题的详细解答：

一、交通肇事罪的认定与公诉条件

交通肇事罪属于公诉案件，其公诉条件需满足以下几点核心要素：

1. 违法违规的交通运输行为：肇事者必须存在违反交通运输管理法规的行为，如超速行驶、闯红灯、酒后驾驶等，这些行为是引发交通事故的直接原因。

2. 对事故负主要或全部责任：根据事故现场勘查、证人证言、交通监控等证据，必须确定肇事者对事故的发生负有主要或全部责任。这是判断肇事者是否应承担刑事责任的关键。

3. 事故造成严重后果：具体包括以下几种情形之一：

   • 死亡一人或者重伤三人以上，且肇事者负事故全部或者主要责任；
   • 死亡三人以上，且肇事者负事故同等责任；
   • 造成公共财产或者他人财产直接损失，且肇事者负事故全部或者主要责任，同时无能力赔偿数额在三十万元以上；
   • 交通肇事致一人以上重伤，且肇事者负事故全部或者主要责任，并具有酒后驾驶、吸食毒品后驾驶、无驾驶资格驾驶、明知是安全装置不全或安全机件失灵的机动车辆而驾驶、严重超载驾驶、为逃避法律追究逃离事故现场等严重违规情形之一。

二、公诉程序与流程

当交通肇事行为构成犯罪时，案件将经历以下公诉程序：

1. 公安机关侦查：公安机关将对交通事故进行现场勘查、调查取证，形成详细的侦查报告，并将案件移送至检察院审查起诉。

2. 检察院审查起诉：检察院将对公安机关移送的案件进行全面审查，包括犯罪事实是否清楚、证据是否确实充分等。若认为犯罪事实清楚，证据确实充分，依法应当追究犯罪嫌疑人刑事责任的，检察院将向法院提起公诉。

3. 法院审判：法院将受理检察院提起的公诉案件，并依法进行审理。在审理过程中，法院将听取控辩双方的意见，审查证据，并根据事实和法律规定作出判决。

三、不构成交通肇事罪的情况处理

若交通肇事行为情节较轻，未造成严重后果，或者虽然造成一定后果但不符合上述犯罪标准的，则不会由检察院公诉。这种情况一般按照民事侵权纠纷处理，当事人可以自行协商解决赔偿问题，或者请求公安机关交通管理部门进行调解。若协商或调解不成，当事人可以向法院提起民事诉讼来解决赔偿等问题。

总结

交通肇事案件是否由检察院公诉，关键在于交通肇事行为是否构成交通肇事罪。若构成犯罪，且满足公诉条件，则案件将依法进入公诉程序；若不构成犯罪，则按民事侵权纠纷处理。在处理此类案件时，应严格遵循法律法规，确保公正、公平地维护各方当事人的合法权益。希望以上解答能对您有所帮助。