结论：能否仅对能联系上的两人进行赔付，需结合保险合同条款、保险事故性质及法律规定综合判断，具体分以下两种情况：
若保险合同明确约定“被保险人为多人时，部分人失联不影响其他被保险人赔付”
例如，合同中写明“本保险单下被保险人为A、B、C三人，若其中一人无法联系，保险公司仍应对其他可联系被保险人按约定赔付”，则可直接依据合同对两人进行赔付。此时，合同条款具有优先效力，保险公司不得以“部分被保险人失联”为由拒绝赔付。
若保险合同未明确约定，或约定“需全体被保险人配合才能赔付”
此时需进一步分析保险事故性质及法律规定：
- 若保险事故是“可分割的独立事件”（如三人分别投保了独立的意外险，事故是三人各自遭遇的不同意外），则保险公司应分别对能联系上的两人进行赔付，失联者的赔付可暂缓或通过公告程序处理。
- 若保险事故是“不可分割的共同事件”（如三人共同投保了家庭财产险，房屋因火灾损毁），且合同要求全体被保险人共同申请赔付，则可能因一人失联导致赔付程序受阻。但根据《保险法》第二十一条，保险公司有义务主动调查事故情况，不能仅以“部分被保险人失联”为由完全拒绝赔付，可通过公告、委托第三方调查等方式推进程序。
建议：
- 立即查阅保险合同中“被保险人”“赔付程序”“失联处理”等条款，明确合同约定；
- 若合同未明确，可要求保险公司出具书面拒赔理由，并依据《保险法》第十七条（保险公司对免责条款的说明义务）主张权利；
- 若保险公司仍拒绝，可向当地银保监会投诉或通过诉讼解决，诉讼中需提供保险事故证据（如报警记录、医疗证明等）及联系不上被保险人的证明（如社区证明、通话记录等）。
提示：保险赔付问题涉及合同解释、证据固定等多环节，建议尽快整理合同、事故证据等材料，如有疑问可直接向我咨询具体处理方案。