发包人是否承担责任需视具体情况而定，以下分情况讨论：
合同有明确约定：
- 若发包人与承包人签订的合同中，明确规定了因配合防汛等不可抗力或政府指令性行为导致的损失分担方式，那么双方应严格按照合同约定执行。例如，合同中可能约定此类损失由发包人承担，或者由双方按一定比例分担。在此情况下，发包人是否承担责任及承担多少责任，均以合同条款为准。
合同无明确约定，但发包人存在过错：
- 如果合同中没有明确约定损失分担方式，但发包人在防汛过程中存在过错，如未及时提供必要的防汛设备、未按照政府要求采取防汛措施等，导致承包人养鱼损失扩大，那么发包人可能需要承担相应的赔偿责任。这种责任属于过错责任，即发包人因其过错行为而承担的法律后果。
合同无明确约定，且发包人无过错：
- 若合同中没有明确约定损失分担方式，且发包人在防汛过程中没有过错，那么根据公平原则和诚实信用原则，发包人可能不需要承担承包人的养鱼损失。但在此情况下，双方可以协商解决损失分担问题，如通过友好协商达成补偿协议等。如果协商不成，承包人可能需要自行承担损失，或者通过其他途径（如保险理赔）来弥补损失。
法律建议：
- 审查合同条款：首先，承包人应仔细审查与发包人签订的合同，查看是否有关于因配合防汛等不可抗力或政府指令性行为导致的损失分担的明确约定。
- 收集证据：如果承包人认为发包人应承担责任，应收集相关证据，如防汛通知、政府指令、损失清单、照片或视频等，以证明损失的存在和发包人的过错（如果存在）。
- 协商与诉讼：在收集到足够证据后，承包人可以与发包人进行协商，寻求合理的损失补偿。如果协商不成，承包人可以考虑通过法律途径解决争议，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
可能法律后果：
- 如果发包人被认定需要承担责任，可能面临支付赔偿金、恢复原状等法律后果。
- 如果发包人被认定不需要承担责任，承包人可能需要自行承担损失，或者通过其他途径来弥补损失。
在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同，因此建议承包人在遇到此类问题时，及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的应对策略。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。