工程总承包在特定条件下是可以直接发包的，但这一行为必须严格遵守相关法律法规和程序要求。以下是对这一问题的详细解答：
可以直接发包的情形
涉及国家安全、国家秘密、抢险救灾或特殊政策项目：
- 这类项目因其特殊性，往往不适宜通过公开招标进行发包。例如，抢险救灾工程需要迅速响应，以保障人民生命财产安全；涉及国家安全或秘密的工程项目，则需要严格的保密措施。在这些情况下，直接发包能够更高效地推进项目实施。
使用不可替代的专利或专有技术：
- 当工程项目必须采用特定的、不可替代的专利或专有技术时，只有掌握该技术的单位才能胜任。此时，直接发包给拥有该技术的企业是合理的选择，以确保项目的顺利实施和技术要求的满足。
采购人自行建设、生产或提供的能力：
- 如果建设单位自身具备完成工程项目所需的技术、人员和设备条件，那么可以直接进行建设，无需对外发包。这适用于一些大型企业集团或专业机构，它们拥有专业的工程建设队伍和丰富的经验。
特许经营项目投资人自行建设能力：
- 对于通过招标选定的特许经营项目投资人，如果其具备自行建设、生产或提供服务的能力，那么可以直接负责项目的实施。这有助于保持项目的一致性和连续性。
在建工程追加的附属或加层工程：
- 在建工程需要追加附属小型工程或进行主体加层时，如果原中标单位仍具备承包能力，并且更换承包单位会对工程施工或功能配套产生不利影响，那么可以直接将追加工程发包给原中标单位。这有利于保证工程的整体协调性和施工质量。
直接发包的相关程序与合规性
程序要求：
- 即使符合直接发包的条件，建设单位也必须遵循一定的程序和规定。这包括提供充分的证明材料，说明直接发包的理由和依据，并按照当地建设行政主管部门的要求进行备案等手续。
合规性：
- 直接发包必须严格遵守相关法律法规，如《中华人民共和国建筑法》等，确保发包过程的合法性和公正性。同时，也要加强对工程质量和安全的监督和管理，确保工程项目的顺利实施和交付使用。
分包管理：
- 对于项目中的专业作业部分，如幕墙、消防等，如果需要分包给有资质的单位，也必须遵守相关分包管理规定。这包括确保分包单位的资质和能力符合要求，并签订明确的分包合同，以明确双方的权利和义务。
总结与建议
工程总承包在特定条件下可以直接发包，但这一行为必须建立在合规、公正和保障工程质量与安全的基础上。建设单位应充分了解并遵守相关法律法规和程序要求，确保直接发包的合理性和有效性。同时，也要加强对工程项目的全面管理和监督，包括工程进度、质量、安全等方面的管理，以确保工程项目的顺利实施和高质量完成。如果建设单位对直接发包的程序和要求存在疑问，建议咨询专业的法律或工程咨询机构，以获取更详细和准确的指导。