结论：小三在将情人转账的钱归还后，是否还会被起诉，取决于多种因素，包括转账的性质、原配的意愿以及证据情况等。以下是对此问题的详细分析。
一、转账性质的影响
赠与性质：
- 如果情人给小三的转账被认定为赠与，且该赠与行为未经原配同意，那么原配有权要求撤销赠与并追回财产。在这种情况下，即使小三已经归还了钱款，如果原配认为撤销赠与的法定条件成立（如赠与行为侵害了原配的合法权益），原配仍可能通过法律途径追究相关责任，但主要是针对情人而非小三，除非能证明小三存在恶意或过错。不过，从实际操作层面看，若钱款已归还，原配再行起诉小三要求进一步责任的可能性会大大降低。
借款或其他性质：
- 如果转账被认定为借款或其他性质的法律关系，那么情况会有所不同。例如，如果情人主张转账是借款，并要求小三归还，而小三已经归还，则通常不会因此被起诉。但如果情人或原配能提供证据证明转账存在其他违法或不当行为（如诈骗、侵占等），则可能引发新的法律纠纷。
二、原配的意愿
- 原配是否选择起诉小三，还取决于其个人意愿。有些原配可能更关注于追回财产，而一旦财产得到归还，可能就不再追究小三的法律责任。然而，也有一些原配可能出于情感、道德或其他方面的考虑，选择继续追究小三的责任。
三、证据情况
- 在任何法律纠纷中，证据都是至关重要的。如果原配能够提供充分的证据证明小三存在过错或违法行为（如明知对方有配偶而与之保持不正当关系，并接受大额财物等），那么即使小三已经归还了钱款，原配仍可能通过法律途径追究其责任。但这种情况相对较少见，且需要具体的证据支持。
四、法律建议
对于小三而言：
- 如果已经归还了情人转账的钱款，并且没有其他违法行为或过错，那么被起诉的风险会大大降低。但为了确保自身权益，建议小三在归还钱款时保留相关证据（如转账记录、收条等），以备不时之需。
对于原配而言：
- 如果发现情人给小三转账，并且认为该行为侵害了自己的合法权益，可以先尝试与情人和小三进行协商解决。如果协商无果，可以考虑通过法律途径追究相关责任。但在起诉前，务必收集充分的证据来支持自己的主张。
对于情人而言：
- 应该认识到与小三保持不正当关系并转账给其钱款的行为可能引发的法律后果。如果已经发生了此类行为，并且被原配发现，建议积极与原配沟通并尝试解决问题，以避免进一步的法律纠纷。
总结：小三在将情人转账的钱归还后是否还会被起诉，并没有一个确定的答案。它取决于转账的性质、原配的意愿以及证据情况等多种因素。如果有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。