三方协议的章可以是电子章，但需满足一定条件，且不适用于特定情形。以下是对此问题的详细分析：

电子章的法律效力

根据《中华人民共和国电子签名法》，电子签名（包括电子章）在法律上是被认可的，经其签署的合同具有法律效力。但有效的电子合同需满足三项核心要求：

1. 真实身份验证：确保签署人的身份真实可靠，通常通过CA证书或公安部eID认证系统来实现。
2. 防篡改技术：采用哈希值等防篡改技术，确保文件内容在签署后不被篡改。
3. 签署时间记录：精准记录合同的签订时间，以证明签署的时效性。

许多第三方电子合同平台已经实现了上述要求，从而保障了电子公章的法律效应。

三方协议使用电子章的适用性

1. 一般适用性：在三方协议中，如果各方同意并满足上述电子合同的有效条件，那么使用电子章是合法的，且合同具有法律效力。
2. 不适用情形：然而，根据《电子签名法》的规定，电子印章并不适用于所有情况。特别是与人身所有权（如婚姻、收养、继承）、不动产权益转让（如土地、房屋）、以及停止供应水电气等公共事业服务相关的文书，不适用电子印章。如果三方协议涉及这些特殊领域，则不能使用电子章。

法律建议

1. 确认协议内容：在使用电子章签署三方协议前，务必确认协议内容是否涉及上述不适用电子印章的情形。
2. 选择可靠平台：如果决定使用电子章，应选择一个可靠、合规的第三方电子合同平台，以确保电子签名的真实性和合法性。
3. 保留证据：在签署过程中，应保留好所有相关的电子证据，如签署记录、身份验证信息等，以备不时之需。

举例说明：假设有三家公司A、B、C签署了一份三方合作协议，内容是关于一项商业合作的条款和条件。如果这份协议不涉及人身所有权、不动产权益转让或公共事业服务等领域，且各方同意使用电子章进行签署，那么这份协议在法律上是有效的。

如果您在三方协议中使用电子章方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。