房屋征收协议不予公开的主要理由通常涉及个人隐私保护，但这一理由并非绝对，需结合公共利益进行综合考量。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、个人隐私保护的角度
根据《中华人民共和国政府信息公开条例》第十五条的规定，涉及商业秘密、个人隐私等公开会对第三方合法权益造成损害的政府信息，行政机关不得公开。房屋征收协议中往往包含被征收人的个人信息，如姓名、住址、补偿金额等，这些信息属于个人隐私范畴。因此，从保护个人隐私的角度出发，行政机关可能会以涉及个人隐私为由，拒绝公开房屋征收协议。
二、公共利益优先的角度
然而，个人隐私并非绝对不可公开。在涉及公共利益时，个人隐私需向公共利益作出适当让渡。房屋征收协议及其履行情况属于典型的土地征收、房屋征收领域政府信息，依法不仅应当公开，而且还属于从县级政府到乡镇街道都应当依职权主动公开的范畴。这是因为房屋征收涉及众多被征收人的切身利益，信息公开是保障公众知情权、监督权的重要手段。如果行政机关以涉及个人隐私为由拒绝公开，可能会损害公共利益，如影响征收项目的透明度、引发社会质疑等。
三、具体操作中的平衡
在实际操作中，行政机关需要平衡个人隐私保护与公共利益之间的关系。具体来说：
书面征求第三方意见：根据《中华人民共和国政府信息公开条例》第三十二条的规定，依申请公开的政府信息公开会损害第三方合法权益的，行政机关应该书面征求第三方意见。这意味着，在涉及个人隐私的房屋征收协议公开问题上，行政机关应当先书面征求被征收人的意见，再结合其意见确定是否公开。
采取技术手段保护隐私：如果行政机关认为公开房屋征收协议对公共利益有重大影响，且被征收人不同意公开，那么行政机关可以采取技术手段对协议中的个人信息进行遮挡、模糊化处理，以保护被征收人的隐私。
遵循比例原则：在平衡个人隐私与公共利益时，行政机关应当遵循比例原则。即公开信息的利益应当明显大于不公开信息的损害，且应当选择对个人隐私权影响最小的方式来公开信息。
四、法律后果与救济途径
如果行政机关以涉及个人隐私为由拒绝公开房屋征收协议，且这一决定不符合法律规定或比例原则，那么被征收人可以通过行政复议或行政诉讼等途径寻求救济。在复议或诉讼过程中，被征收人需要提供证据证明行政机关的决定违法或不当，并请求复议机关或法院撤销该决定，责令行政机关重新作出答复。
建议：如果您作为被征收人，认为行政机关以涉及个人隐私为由拒绝公开房屋征收协议的决定违法或不当，您可以先尝试与行政机关沟通协商，要求其重新审查并作出答复。如果沟通无果，您可以向复议机关申请行政复议或向法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。在处理此类问题时，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议。