企业破产债权人垫付的员工工资，在债权申报上不受时效期限限制，但职工在知道自己的债权受到损害后提起诉讼的，应遵守三年的诉讼时效期间。以下是对这一问题的详细分析：
一、债权申报不受时效限制
法律依据：
- 根据《中华人民共和国企业破产法》第四十八条的规定，债务人所欠职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用和根据法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金，均属于无需职工主动申报的债权。
- 这些债权由管理人负责调查并列出清单进行公示，旨在保障职工的基本生活和合法权益，避免职工因不了解申报程序或错过申报期限而受损。
实践意义：
- 无需申报的债权制度设计，体现了法律对职工这一弱势群体的特殊保护。在破产程序中，职工往往处于信息不对称和谈判能力较弱的地位，因此法律通过规定无需申报的债权，确保了职工的基本权益不受损害。
二、诉讼时效的适用
一般规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
- 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
破产程序中的特殊规定：
- 在破产程序中，虽然职工债权在申报上不受时效限制，但如果职工在知道自己的债权受到实际损害（如管理人未正确列出或拒绝更正）后决定提起诉讼的，则应在三年内提出。
- 这是因为，诉讼时效制度的设计旨在督促权利人及时行使权利，避免权利长期处于不确定状态。在破产程序中，虽然职工债权享有特殊保护，但并不意味着可以无限期地拖延诉讼。
三、实际操作建议
及时关注债权公示：
- 职工应密切关注管理人公布的债权清单，确保自己的债权得到正确列出。如果发现清单记载有误或遗漏，应及时要求管理人更正。
及时行使诉讼权利：
- 如果管理人拒绝更正或职工对更正结果不满意，应及时向人民法院提起诉讼。在提起诉讼时，应注意遵守三年的诉讼时效期间，避免因超过时效而丧失胜诉权。
保留相关证据：
- 职工在主张债权时，应保留好相关证据，如工资单、劳动合同、医疗费用票据等。这些证据将有助于证明债权的存在和金额，提高诉讼的成功率。
举例说明：假设某企业破产后，管理人公布的债权清单中遗漏了职工张三的工资债权。张三在发现后及时要求管理人更正，但管理人拒绝更正。此时，张三应在知道自己的债权受到损害之日起三年内向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。如果超过三年未提起诉讼，张三可能会因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
综上所述，企业破产债权人垫付的员工工资在债权申报上不受时效期限限制，但职工在知道自己的债权受到损害后提起诉讼的，应遵守三年的诉讼时效期间。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。