当两份合同对同一事项做出了不同的规定时，法律上的认定并非简单直接，而是需要综合多方面因素进行考量。以下是我为您详细梳理的认定流程：
一、审查合同订立的时间先后
后签合同优先原则：
- 一般情况下，如果后签订的合同是对前合同的变更或补充，并且双方对变更或补充内容无异议，那么以后签订的合同为准。这是因为后合同通常反映了双方最新的合意，体现了合同关系的最新状态。
无时间先后之分的情况：
- 如果两份合同没有明显的时间先后之分，且内容相互冲突，那么需要综合考虑合同签订的背景、双方的履约行为等因素，来判断哪份合同更能反映双方的真实意愿。这可能需要借助合同解释方法，如文义解释、体系解释、目的解释等，来探寻当事人的真实意思表示。
二、考量合同主体的真实意思表示
意思表示的真实性：
- 合同双方的意思表示必须真实，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如果有一份合同是在违背当事人意愿的情况下签订的，那么这份合同的效力可能会受到限制。
欺诈、胁迫等情形的处理：
- 如果存在欺诈、胁迫等导致合同意思表示不真实的情况，受损害方有权请求撤销合同。这是为了保护合同当事人的合法权益，防止因不公平的交易条件而遭受损失。
三、检查合同内容的合法性
合同内容的合规性：
- 合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。如果合同约定从事违法活动，那么该合同自然无效。
核心条款与权利义务变更：
- 如果合同差异涉及合同核心条款或双方权利义务的重大变更，且无法协商一致，那么可能需要根据具体情况判断是否构成重大误解、显失公平等可撤销情形，或者因违反法律法规强制性规定而无效。
四、依据法律法规及交易习惯认定
法律法规的适用：
- 在无法确定双方真实意思表示的情况下，可能会依据相关法律法规及交易习惯等来进行认定。这是为了维护市场秩序和公平交易原则。
交易习惯的考量：
- 交易习惯在合同解释和认定中也起着重要作用。如果双方在长期的交易过程中形成了某种习惯或惯例，那么在合同内容存在冲突时，可以参照这些习惯或惯例来进行认定。
五、建议与解决途径
双方协商：
- 当遇到两份合同内容不一样的情况时，建议双方尽量协商解决。通过友好沟通，可以达成新的合意，从而避免不必要的法律纠纷。
法律途径：
- 如果协商不成，双方可以通过法律途径寻求公正裁决。可以依据《民法典》等相关法律法规，请求人民法院或仲裁机构对合同进行解释或裁决，以明确双方的权利义务，保障合同的顺利履行。
综上所述，当两份合同对同一事项做出了不同的规定时，法律上的认定需要综合多方面因素进行考量。建议您在遇到此类情况时，及时咨询专业法律人士，以便更好地维护自己的合法权益。