结论：在合同纠纷中，若两份合同内容相同但约定“以后一份合同为准”，这通常意味着后一份合同是对前一份合同的修改或补充，应以最后签署的合同内容为准。但具体还需根据合同条款、双方行为及法律规定综合判断。
法律解释与背景：
合同变更原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。若两份合同内容存在差异，且后一份合同明确约定“以后一份合同为准”，这通常被视为双方对合同内容的变更，应以变更后的合同内容为准。
合同解释规则：
- 当合同条款存在歧义或不明确时，应依据合同的目的、交易习惯以及诚实信用原则进行解释。若两份合同均真实有效，且后一份合同未违反法律、行政法规的强制性规定，未违背公序良俗，那么后一份合同的约定应具有优先效力。
特殊情况考虑：
- 恶意串通：如果后一份合同的签订存在恶意串通，损害国家、集体或第三人利益的情况，那么该合同可能被认定为无效，此时应以有效的前一份合同为准。
- 显失公平或欺诈：若后一份合同是在一方利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形下签订的，且显失公平或存在欺诈行为，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构予以撤销，撤销后则应以撤销前的合同内容为准。
法律建议：
审查合同条款：
- 在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于合同变更、解释及争议解决的条款，确保合同内容明确、无歧义。
保留证据：
- 在合同履行过程中，应保留好与合同相关的所有证据，如邮件、短信、聊天记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
及时咨询：
- 若对合同条款或合同履行过程中出现的问题有疑问，应及时咨询专业律师，以便得到专业的法律意见和帮助。
可能法律后果：
- 若后一份合同被认定为有效且优先适用，那么双方应按照后一份合同的约定履行义务，否则可能构成违约，需承担违约责任。
- 若后一份合同被认定为无效或被撤销，那么双方应恢复至前一份合同的状态，或根据实际情况重新协商确定合同内容。
如有任何合同纠纷方面的法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。