工资流水本身并不能直接证明该流水对应的款项是由某公司支付的，但可以作为辅助证据来支持这一事实。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
工资流水的性质与证明力
工资流水，即银行账户的交易记录，显示了账户内资金的流入和流出情况。在劳动争议中，工资流水通常被用作证明劳动者与用人单位之间存在劳动关系以及劳动者工资收入情况的证据。然而，单纯的工资流水并不足以直接证明款项的支付方是某公司，因为它只显示了资金的流动，而没有直接显示支付方的信息。
如何增强工资流水的证明力
结合劳动合同：
- 如果劳动者能提供与用人单位签订的劳动合同，那么劳动合同中明确记载的用人单位信息与工资流水中的支付方信息（如果能够对应上）相结合，可以大大增强工资流水证明款项由公司支付的说服力。
结合其他证据：
- 劳动者还可以提供其他证据来辅助证明，如工作证、考勤记录、同事证言等，这些证据可以形成一个完整的证据链，共同证明劳动者与用人单位之间的劳动关系以及工资的支付方。
银行盖章确认：
- 在某些情况下，劳动者可以要求银行在工资流水上盖章确认，以证明该流水的真实性和准确性。虽然这并不能直接证明支付方是公司，但可以增加流水的可信度。
可能的法律后果与建议
- 如果劳动者需要证明工资是由某公司支付的：建议劳动者在收集工资流水的同时，尽量收集其他相关证据，如劳动合同、工作证等，以形成一个完整的证据链。
- 如果用人单位否认支付工资：劳动者可以凭借工资流水和其他证据向劳动争议仲裁委员会或法院提起仲裁或诉讼，要求用人单位确认劳动关系并支付工资。
实际操作中的注意事项
- 确保工资流水的真实性：劳动者应确保提供的工资流水是真实有效的，没有经过篡改或伪造。
- 及时收集证据：在发生劳动争议时，劳动者应及时收集相关证据，以免因时间过长而导致证据丢失或难以收集。
- 咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，如果劳动者在处理劳动争议时遇到困难或疑问，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。
综上所述，工资流水本身并不能直接证明款项是由某公司支付的，但可以作为辅助证据来支持这一事实。劳动者在收集工资流水的同时，应尽量收集其他相关证据以形成一个完整的证据链。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。