三甲医院护士与单位人事处签合同和与科室签合同，主要存在以下不同：
合同主体与法律关系
- 与单位人事处签合同：这种情况下，护士是与医院这一整体法人单位建立劳动关系。合同主体是护士与医院，双方之间的权利义务关系受《中华人民共和国劳动合同法》等法律法规的调整。这种合同形式更规范，能更好地保障护士的合法权益，如工资、福利、社会保险等。同时，医院作为整体法人单位，对护士的管理和调度也更为统一和有序。
- 与科室签合同：若护士是与科室签订合同，则合同主体可能是护士与科室这一内部机构。然而，科室通常不具备独立的法人资格，无法独立承担民事责任。因此，这种合同形式在法律上可能存在一定的问题。如果科室无法履行合同义务，护士可能难以直接向科室主张权利，而需要向医院这一整体法人单位寻求救济。
合同内容与稳定性
- 与单位人事处签合同：合同内容通常更为全面和稳定，会明确规定护士的工作岗位、工作职责、工资待遇、社会保险、福利待遇等。由于是与医院整体签订合同，护士的工作岗位和职责相对稳定，不易受到科室内部调整的影响。
- 与科室签合同：合同内容可能相对简单，且稳定性较差。科室可能根据工作需要随时调整护士的工作岗位和职责，甚至可能因科室撤销、合并等原因导致合同无法继续履行。这种情况下，护士的权益可能难以得到充分保障。
纠纷解决与法律责任
- 与单位人事处签合同：如果发生劳动纠纷，护士可以直接向医院主张权利，通过劳动仲裁或诉讼等途径解决纠纷。医院作为整体法人单位，对纠纷的解决负有直接责任。
- 与科室签合同：如果发生纠纷，护士可能需要先向科室主张权利，但科室可能无法独立承担民事责任。这种情况下，护士可能需要进一步向医院寻求救济，增加了纠纷解决的复杂性和不确定性。
法律建议：
- 对于护士而言，建议优先选择与医院整体（即单位人事处）签订劳动合同，以更好地保障自己的合法权益。
- 如果确实需要与科室签订合同，应仔细审查合同内容，确保合同条款明确、合法、有效，并尽可能要求科室提供担保或由医院作为连带责任保证人。
- 在签订合同前，护士应充分了解自己的权利和义务，以及合同可能带来的法律后果。如有疑问，应及时咨询专业律师。
可能后果：
- 如果护士选择与科室签订合同且合同内容不明确或存在违法条款，可能导致护士的权益受损且难以得到充分保障。
- 在发生劳动纠纷时，如果科室无法独立承担民事责任，护士可能需要通过更复杂的法律程序来维护自己的权益。