工程合同结算时，一般可以以补充合同进行结算，但需满足一定条件。以下从不同角度为您详细分析：

一、补充合同的有效性条件

1. 民事行为能力：双方当事人需具备相应的民事行为能力，即能够理解自己签订合同的行为及后果。这是合同有效的基础前提。

2. 意思表示真实：双方的意思表示必须真实，不存在欺诈、胁迫等情况。如果补充合同是在一方受欺诈或胁迫的情况下签订的，那么该合同可能无效。

3. 内容合法合规：合同内容不能违反法律、行政法规的强制性规定，也不能损害国家、集体和他人的合法权益。例如，补充合同不能约定逃避纳税义务等非法内容。

二、补充合同的作用

在工程合同结算中，补充合同通常用于对原合同结算部分的进一步明确或补充。例如：

• 明确结算方式：原合同结算条款可能表述模糊，补充合同可以清晰地界定是按固定总价结算还是按单价计量结算。
• 确定结算时间：避免结算时间无限期拖延，补充合同可以明确具体的结算时间节点。
• 规定结算依据：如以何种标准的工程量清单进行结算等关键内容，补充合同都可以进行明确规定。

三、补充合同可能无效的情形

尽管补充合同在工程合同结算中通常有效，但也存在一些可能导致其无效的情形：

1. 以合法形式掩盖非法目的：例如，通过补充合同逃避纳税义务等非法行为，该补充合同将无效。

2. 恶意串通损害第三人利益：如果双方恶意串通，通过补充合同损害第三人的利益，那么该合同也将无效。

四、法律建议

1. 签订前审查：在签订工程结算补充合同前，双方应仔细审查合同内容，确保符合上述有效性条件。

2. 保留证据：签订过程中，双方应保留好相关证据，如会议纪要、往来邮件等，以备不时之需。

3. 争议解决：如果对补充合同的效力存在疑问或发生争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决争议。

举例说明：假设某工程原合同结算条款约定不明，双方随后签订了工程结算补充合同，进一步明确了结算方式、时间等内容。如果该补充合同符合双方当事人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律行政法规强制性规定等条件，那么该补充合同就是有效的，双方可以按照补充合同的约定进行结算。

如果您在工程合同结算过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。