快递只赔损失不赔付运费是否合理，需分情况讨论：
一、合理情况
合同约定优先：
- 快递服务本质上是一种商业合同行为，快递公司提供的运单条款中通常会明确赔偿标准。如果运单条款中明确规定了“只赔损失不赔运费”，且寄件人在寄送时选择了接受该条款（如通过勾选同意、签字确认等方式），那么该条款对双方均具有约束力。在这种情况下，快递公司按照合同约定进行赔偿，是合理的。
保价服务特性：
- 如果寄件人选择了保价服务，并支付了相应的保价费，那么快递公司的赔偿责任通常限于保价金额内。保价服务本质上是一种风险转移机制，寄件人通过支付保价费，将货物在运输过程中的风险部分转移给快递公司。因此，在保价金额内，快递公司只赔偿损失（即保价金额或按比例计算的实际损失），而不额外赔偿运费，也是符合保价服务特性的。
二、不合理情况
格式条款无效：
- 如果快递公司提供的运单条款属于格式条款，且该条款不合理地加重了寄件人的责任或排除了寄件人的主要权利（如仅赔偿损失而不赔偿运费，且该损失远低于货物实际价值及运费总和），那么该条款可能被认定为无效。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，提供格式条款一方不合理地免除或者减轻其责任、加重对方责任、限制对方主要权利的，该格式条款无效。
快递公司过错：
- 如果货物丢失或损坏是由于快递公司的故意或重大过失造成的，那么快递公司不能仅以合同约定为由拒绝赔偿运费。在这种情况下，快递公司应当承担与其过错相应的赔偿责任，包括赔偿货物的实际损失以及因货物丢失或损坏而产生的合理费用（如运费）。
三、法律建议与实际操作
寄件时选择保价服务：
- 对于贵重或重要的货物，建议寄件人在寄送时选择保价服务，并仔细阅读赔偿条款。通过保价服务，可以在一定程度上降低货物在运输过程中的风险，并在发生丢失或损坏时获得更充分的赔偿。
保留好相关证据：
- 在寄送货物时，务必保留好寄件单据、支付凭证等相关证据。这些证据在发生纠纷时可以作为证明货物价值、运费金额以及快递公司过错的重要依据。
协商与法律途径：
- 如果发生货物丢失或损坏且对赔偿金额有异议，首先可以尝试与快递公司进行协商。如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向消费者协会投诉、提起民事诉讼等。
总结来看，快递只赔损失不赔付运费是否合理，取决于合同约定、保价服务特性以及快递公司的过错情况。在实际操作中，建议寄件人充分了解赔偿条款、选择保价服务并保留好相关证据，以便在发生纠纷时能够依法维护自己的合法权益。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。