当事人对交通事故认定认同，但车主不认同的情况下，车主是可以申请复核的。以下是对此问题的详细分析：

一、复核的法律依据

根据相关法律规定，当事人若对道路交通事故认定或出具的道路交通事故证明有异议，可自道路交通事故认定书或证明送达之日起三日内提出书面复核申请。这一规定同样适用于车主，即使交通事故的当事人（如驾驶员）已经认同事故认定，车主作为利害关系人，仍有权提出复核申请。

二、复核申请的条件与流程

1. 申请时限：车主应在收到道路交通事故认定书或证明之日起三日内提出复核申请，逾期提交将不予受理。
2. 申请内容：复核申请需载明复核请求、理由及主要证据。车主应详细阐述对事故认定的异议点，并提供相关证据支持其复核请求。
3. 复核次数限制：同一事故的复核以一次为限。车主应珍惜这次复核机会，确保申请内容充分、有力。
4. 复核审查：上一级公安机关交通管理部门自受理复核申请之日起三十日内，会对道路交通事故认定的事实、证据、适用法律、责任划分及调查及认定程序进行审查，并作出复核结论。

三、复核的可能结果

1. 维持原认定：若上一级公安机关交通管理部门认为原道路交通事故认定事实清楚、证据充分、责任划分公正且调查及认定程序合法，将维持原认定。
2. 责令重新调查、认定：若认为原认定事实不清、证据不足、责任划分不公正或调查及认定违反法定程序，将作出责令原办案单位重新调查、认定的复核结论。

四、建议与注意事项

1. 及时申请：车主应在规定时限内及时提出复核申请，以免错过复核机会。
2. 充分准备：在提出复核申请前，车主应充分准备相关证据和理由，确保申请内容充分、有力。
3. 遵守程序：车主应严格遵守复核申请的程序和要求，确保申请的合法性和有效性。
4. 寻求专业帮助：如果车主对复核申请流程或相关法律问题不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保障。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。