交通肇事罪到检察院三个月了没消息，并不意味着一定不起诉。下面是对此情况的具体分析：

一. 不起诉的可能性

1. 酌定不起诉：根据《刑事诉讼法》的相关规定，如果犯罪嫌疑人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，检察机关可以根据具体情况决定不起诉。但这需要检察机关进行具体审查，并不是时间到了就自动不起诉。
2. 案件复杂性：有些交通肇事案件可能涉及复杂的情节或多方责任，需要检察机关进行更深入的调查和审查。这可能会延长案件的处理时间，但并不意味着最终会不起诉。

二. 可能仍在审查起诉阶段

• 检察机关在收到案件后，会进行详细的审查，包括审查案件事实、证据材料、适用法律等。这个审查过程可能需要一定的时间，特别是当案件涉及复杂情节或需要补充调查时。
• 在审查起诉阶段，检察机关可能会与犯罪嫌疑人、被害人及其代理人进行沟通，听取各方意见，这也需要一定的时间。

三. 我的建议

• 保持沟通：如果您是犯罪嫌疑人或其家属，可以与检察机关保持沟通，了解案件进展情况和可能的结果。
• 耐心等待：由于案件处理需要一定的时间，特别是涉及复杂情节的案件，因此建议您耐心等待检察机关的决定。
• 准备应对：同时，您也可以做好应对准备，包括准备辩护材料、寻找证人等，以便在需要时能够迅速应对。

综上所述，交通肇事罪到检察院三个月了没消息，并不意味着一定不起诉。您应该保持与检察机关的沟通，耐心等待审查结果，并做好应对准备。如有进一步需要，您可以继续咨询我。