公司清算完毕证明一般由负责清算的清算组或管理人出具。以下是对此问题的详细分析：
一、清算完毕证明的出具主体
在公司清算过程中，清算组或管理人负责处理公司的财产、债权债务等事务，并在清算结束后编制清算报告。这份清算报告，在经过相关程序（如股东会、股东大会或人民法院确认）后，实际上就起到了清算完毕证明的作用。它详细记录了清算的过程、结果以及财产的分配情况，是证明公司清算已经完毕的重要文件。
清算组出具：
- 对于非破产清算（如自愿解散清算），清算组通常由公司股东、董事或有关机关指定的人员组成。
- 清算组在完成清算工作后，会编制清算报告，并提交给股东会或股东大会进行确认。
- 确认后的清算报告，即可视为公司清算完毕的证明。
管理人出具：
- 对于破产清算，法院会指定管理人负责清算工作。
- 管理人在完成清算工作后，会编制清算报告，并提交给法院进行确认。
- 法院确认后的清算报告，同样可以视为公司清算完毕的证明。
二、清算完毕证明的内容与效力
清算完毕证明（即清算报告）通常包含以下内容：
- 清算的原因、起始日期；
- 清算组的组成情况；
- 公司的财产、债权债务处理情况；
- 剩余财产的分配情况；
- 清算过程中遇到的问题及解决方案；
- 清算结论等。
这份证明具有法律效力，是公司注销、股东分配剩余财产等后续法律行为的重要依据。
三、注意事项
确保清算程序的合法性：
- 清算过程必须严格遵守法律法规的规定，确保清算程序的合法性和公正性。
- 否则，清算完毕证明可能无法得到相关机构的认可。
及时办理注销手续：
- 在取得清算完毕证明后，公司应及时向工商行政管理部门办理注销手续。
- 否则，公司可能仍需承担一定的法律责任。
保留相关证据：
- 在清算过程中，公司应妥善保留与清算相关的所有证据和文件。
- 以备在后续法律行为中需要时进行查验。
如有任何关于公司清算或相关法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。