结论前置：

1. 通常情况下，公司作为借款人应承担还款责任。
2. 若存在债务混同或股东滥用公司独立地位等特殊情况，特定股东也可能需承担连带责任。

详细分析：

一、公司作为借款人的情况

当公司以自身名义出具借条，并指示出借人将借款打入股东账户时，从法律角度来看，公司仍然是借款人。这是因为借条是表明债权债务关系的书面凭证，公司作为借条的出具方，明确表示了向出借人借款的意愿。款项打入股东账户，可能是出于公司资金安排、财务管理等考虑，但这并不改变借款人的认定。公司应对借款承担还款责任，股东个人账户仅作为资金流转的通道，并不因此成为借款人。

二、股东可能承担连带责任的情况

尽管公司通常是借款人，但在某些特殊情况下，股东也可能需要对债务承担连带责任。这主要包括以下几种情形：

1. 债务混同：当公司与股东的财产混同，导致无法区分公司财产和股东个人财产时，可能构成债务混同。例如，股东长期随意挪用公司资金，或公司与股东的财务账目混乱不清。在这种情况下，出借人可以主张股东与公司对债务承担连带责任。

2. 股东滥用公司独立地位：如果股东利用公司的独立地位恶意逃避债务，损害出借人的利益，出借人也可以主张股东承担连带责任。例如，股东通过控制公司进行不正当交易，或故意将公司资产转移至个人账户以逃避债务。

三、法律建议与风险提示

1. 明确借款主体和收款账户：出借人在出借款项时，应明确要求借款人（即公司）在借条上注明借款主体和收款账户。这有助于确保借贷关系的清晰性和合法性，避免后续法律纠纷。

2. 保留相关证据：出借人应保留与借款相关的所有证据，包括借条、转账记录、沟通记录等。这些证据在后续法律纠纷中可能起到关键作用。

3. 谨慎对待股东个人账户收款：尽管款项可能打入股东个人账户，但出借人应谨慎对待这种情况。如果可能的话，应要求公司出具书面说明，解释款项打入股东账户的原因，并确保该款项确实用于公司经营或偿还公司债务。

4. 及时咨询专业律师：如果出借人对借款人的认定或还款责任存在疑问，应及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见，帮助出借人维护自身权益。

四、可能的法律后果

如果公司未能按时还款，出借人可以通过法律途径追究公司的还款责任。如果存在债务混同或股东滥用公司独立地位等特殊情况，出借人还可以主张股东承担连带责任。这将增加出借人追回借款的可能性，但同时也需要出借人提供充分的证据来支持其主张。

综上所述，公司借款打入股东账户时，通常情况下公司应作为借款人承担还款责任。但在特定情况下，股东也可能需要对债务承担连带责任。出借人在出借款项时应保持警惕，确保借贷过程的合法性和规范性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。