针对超出补偿协议多支付的补偿款，行政机关可以通过以下程序进行追回：

一、内部纠错程序

1. 及时沟通与说明情况：

   • 行政机关在发现多支付补偿款后，应首先与受领人（即多收到补偿款的一方）取得联系，清晰、准确地说明多支付的情况。
   • 提供详细的证明材料，如补偿协议、支付记录、计算依据等，以证实多支付补偿款的事实。

2. 协商追回方式及时间节点：

   • 若受领人认可多支付的情况，双方可协商确定追回方式，如通过转账、现金退还等方式将多支付的款项退回指定账户。
   • 同时，协商确定追回的时间节点，确保追回工作有序进行。

二、法律途径解决

1. 收集证据：

   • 若受领人对多支付情况存在异议，行政机关应收集好相关证据，包括补偿协议、支付记录、计算依据、与受领人的沟通记录等。
   • 这些证据将用于后续的法律程序，以证明多支付补偿款的事实。

2. 提起诉讼：

   • 行政机关可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求法院判决受领人返还不当得利（即多支付的补偿款）。
   • 在诉讼过程中，行政机关需明确诉求，提供充分的证据支持其主张，并承担相应的诉讼费用等合理支出。

3. 法院审理与裁决：

   • 法院将依据事实和法律进行审理，对双方提供的证据进行质证和认证。
   • 若法院认定受领人确实多收到了补偿款，且无法律根据取得该不当利益，将判决受领人返还不当得利。

4. 执行判决：

   • 若判决支持行政机关的追回请求，受领人应按照判决履行义务，及时退还多支付的补偿款。
   • 若受领人拒不履行判决，行政机关可以申请法院强制执行，确保判决得到有效执行。

三、法律依据

• 《中华人民共和国民法典》第一百二十二条：因他人没有法律根据，取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。这一条款为行政机关追回多支付的补偿款提供了法律基础。

四、建议与注意事项

1. 及时沟通：行政机关在发现多支付补偿款后，应尽快与受领人取得联系，避免问题拖延导致追回难度增加。
2. 保留证据：在整个追回过程中，行政机关应妥善保留所有相关证据，以备后续法律程序使用。
3. 合法合规：行政机关在追回多支付的补偿款时，应严格遵守法律法规和程序要求，确保追回工作的合法性和合规性。

若您在征地拆迁领域遇到任何法律问题，包括但不限于补偿协议纠纷、多支付补偿款追回等，都可以直接向我咨询。我会运用我的专业知识和经验，为您提供全面、准确、清晰的法律解答和建议。