纪委对免于刑事处罚的案件，其程序主要依据党内法规及国家法律法规进行，核心程序包括线索受理、初步核实、立案审查、审理及处理决定等环节。具体程序如下：

1. 线索受理与初步核实
   纪委首先通过信访举报、监督检查、巡视巡察等渠道受理问题线索。对免于刑事处罚的案件，纪委需重点核实行为是否违反党纪政纪，即使司法机关未追究刑事责任，若行为构成违纪，纪委仍可启动程序。初步核实阶段，纪委通过调取证据、询问相关人员等方式，判断线索的真实性与严重性。

2. 立案审查
   经初步核实，若证据充分且涉嫌违纪，纪委将立案审查。立案后，成立审查组，全面调查违纪事实，收集证据，包括书证、物证、证人证言等。审查过程中，需保障被审查人的合法权益，如申请回避、陈述申辩等。

3. 审理与处理决定
   审查结束后，案件移送审理部门。审理部门对事实、证据、定性及处理建议进行全面审核，形成审理报告。根据违纪性质和情节，纪委可作出以下处理：

   • 党纪处分：如警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍；
     
   • 政务处分：对公职人员，可给予警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等处分；
     
   • 组织处理：如调整职务、责令辞职、免职等；
     
   • 其他措施：如批评教育、通报批评等。

4. 处理决定的执行与备案
   处理决定作出后，需及时送达被处理人及所在单位，并监督执行。同时，按规定将处理结果报上级纪委备案，确保程序合规。

需注意的关键点：

• “免于刑事处罚”不等于“无违纪”：司法机关未追究刑事责任，但若行为违反党纪政纪，纪委仍可独立追责；
  
• 程序合法性：纪委处理需严格遵循《中国共产党纪律检查机关监督执纪工作规则》《中华人民共和国监察法》等规定，确保程序正当；
  
• 权利保障：被审查人有权申请回避、陈述申辩、申请复核等，纪委需依法保障其权利。

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