公司盖了章的担保协议在以下情况下可能无效：
主体资格问题导致的无效
- 国家机关和以公益为目的的事业单位、社会团体违法提供担保：根据相关法律，国家机关和以公益为目的的事业单位、社会团体不得作为保证人。若它们违法提供了担保，那么担保协议将被视为无效。例如，某学校作为公益事业单位，未经批准为某企业提供担保，该担保协议即无效。
- 董事、高级管理人员未经同意以公司财产提供担保：根据《公司法》的相关规定，董事、高级管理人员不得违反公司章程的规定，未经股东会、股东大会或者董事会同意，以公司财产为他人提供担保。若他们违反了这一规定，那么担保协议也将被视为无效。比如，某公司董事未经股东会同意，擅自以公司资产为朋友的企业提供担保，该担保协议即无效。
- 无权经营外汇担保业务的金融机构或无外汇收入的非金融性质的企业法人提供外汇担保：对于外汇担保，只有具备相应资质的金融机构才能进行。若无权经营外汇担保业务的金融机构或无外汇收入的非金融性质的企业法人提供了外汇担保，那么该担保协议同样无效。
担保物问题导致的无效
- 以法律、法规禁止流通的财产或者不可转让的财产设定担保：如果担保物是法律、法规禁止流通的财产或者不可转让的财产，那么以此设定的担保协议将被视为无效。例如，以非法所得或国家明令禁止流通的物品作为担保物，该担保协议即无效。
未经批准或登记的对外担保合同
- 未经国家有关主管部门批准或者登记对外担保：对于某些特殊类型的对外担保，如为境外机构或个人提供的担保，可能需要经过相关部门的批准或登记手续。若未履行这些手续，那么担保协议可能被视为无效。比如，某企业未经外汇管理部门批准，擅自为境外企业提供担保，该担保协议即可能无效。
主合同无效导致的从合同无效
- 主债权债务合同无效的担保合同：担保合同是主债权债务合同的从合同。如果主债权债务合同因各种原因被认定为无效，如因欺诈、胁迫等手段订立，或者违反法律、行政法规的强制性规定等，那么作为从合同的担保合同也将随之无效。但需注意的是，在某些情况下，即使主合同无效，担保合同中的部分条款（如争议解决条款）仍可能有效。
意思表示不真实导致的无效
- 欺诈、胁迫手段订立的担保合同：如果一方通过欺诈、胁迫等手段使对方在违背真实意思的情况下订立担保合同，那么受损害方有权请求撤销该合同，撤销后合同自始无效。
- 恶意串通损害他人利益的担保合同：双方恶意串通，损害国家、集体或第三人利益的担保合同无效。这种合同不仅损害了第三方的利益，也破坏了市场的公平竞争秩序。
形式要件缺失导致的无效
- 必须采用书面形式而未采用的担保合同：根据法律规定，某些类型的担保合同（如保证合同、抵押合同、质押合同等）必须采用书面形式。如果当事人未按照法律规定的形式订立合同，那么该合同可能被视为无效。
法律建议：
- 在签订担保协议前，务必核实担保人的主体资格和担保物的合法性。
- 确保担保协议的内容合法、合规，并遵循相关法律法规的规定。
- 对于特殊类型的对外担保，如为境外机构或个人提供的担保，应提前了解并履行相关部门的批准或登记手续。
- 在签订担保协议时，建议采用书面形式，并明确约定双方的权利和义务。
可能后果：若担保协议被认定为无效，那么担保人将不再承担担保责任。这可能导致债权人无法追回债务，进而造成经济损失。因此，在签订担保协议时，务必谨慎对待，确保协议的合法性和有效性。
如有任何关于担保协议的法律问题，欢迎直接向我咨询。