结论：分居两年多且起诉三次，即便一方不同意，法院判决离婚的可能性较大，但并非绝对，需综合考量多种因素。
一、法律规定的核心标准
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条，法院判决离婚的核心标准是“夫妻感情确已破裂”。分居满两年是认定夫妻感情破裂的法定情形之一，具体规定如下：
- 因感情不和分居满二年：若能证明分居原因系感情不和，且分居状态连续满两年，法院可认定感情破裂。
- 多次起诉的辅助作用：连续三次起诉离婚，反映夫妻矛盾激化且难以调和，进一步佐证感情破裂。
二、法院判决的综合考量因素
尽管分居两年和多次起诉是重要依据，但法院仍会综合审查以下因素：
- 分居期间的互动情况：
- 若对方能举证证明分居期间仍有共同生活、经济往来或情感交流（如共同照顾子女、节日团聚等），法院可能认为感情未完全破裂。
- 反之，若分居期间无任何互动，且矛盾持续升级，法院更可能判决离婚。
- 是否存在和好可能：
- 法院会评估双方是否有修复感情的基础，例如是否愿意接受调解、是否提出改善关系的具体方案。
- 若一方坚决拒绝调解且无和好意愿，法院倾向于判决离婚。
- 其他法定情形：
- 若存在重婚、家暴、赌博等恶习等法定离婚情形，法院可直接判决离婚，无需依赖分居时间。
三、实务中的判例倾向
根据司法实践，分居两年且起诉三次的案件，法院判决离婚的概率较高，但需满足以下条件：
- 证据充分：需提供分居协议、租房合同、证人证言等证明分居满两年，且分居原因系感情不和。
- 调解无效：法院会组织调解，若双方无法达成和解，且原告坚持离婚，法院更可能判决离婚。
- 无重大争议：若案件不涉及复杂财产分割或子女抚养争议，法院判决离婚的阻力较小。
四、若法院未判离的应对策略
若法院认为感情未完全破裂，可能判决不准离婚。此时，原告可采取以下措施：
- 六个月后再次起诉：
- 根据《民法典》规定，判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次起诉的，应当准予离婚。
- 即使未满一年，若能证明感情持续恶化，法院也可能判决离婚。
- 补充证据：
- 收集分居期间的无互动证明（如聊天记录、消费记录等）。
- 证明对方存在过错（如家暴、出轨等），强化感情破裂的认定。
五、法律建议
- 提前固定证据：
- 签订分居协议，明确分居时间、原因及财产安排。
- 保留租房合同、水电费账单等证明分居状态的证据。
- 积极配合调解：
- 调解是法院必经程序，即使不同意调解结果，也可通过调解展示离婚决心。
- 咨询专业律师：
- 离婚案件涉及财产分割、子女抚养等复杂问题，需结合个案制定诉讼策略。
总结：分居两年多且起诉三次，法院判决离婚的可能性较大，但需以证据充分、调解无效为前提。若对方举证证明感情未破裂，法院可能暂不判离。建议提前固定证据，积极应对诉讼，必要时寻求专业律师帮助。