上诉迟到撤诉处理是否合法，需结合具体情况及法律规定来判断，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律规定层面

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按撤诉处理。但这一规定主要针对的是原告在一审程序中的行为。对于上诉迟到（即二审程序中上诉人未按时到庭）的情况，法律并未直接规定可以按撤诉处理。不过，部分法院在司法实践中，会参照一审的相关规定，对无正当理由拒不到庭的上诉人，作出按自动撤回上诉处理的裁定。但也有法院认为，二审程序中不能直接适用一审关于按撤诉处理的规定，而是会继续审理案件后进行实体判决。

二、司法实践层面

1. 按撤诉处理的情况：

   • 如果上诉人经传票传唤，无正当理由拒不到庭，且法院认为这种行为影响了诉讼程序的正常进行，可能会参照一审的规定，作出按自动撤回上诉处理的裁定。这种情况下，撤诉处理是合法的，但它是基于法院对诉讼程序和当事人行为的综合判断。

2. 不按撤诉处理，继续审理的情况：

   • 如果法院认为上诉人的迟到并未对诉讼程序造成实质性影响，或者上诉人有合理的理由未能按时到庭，法院可能会选择继续审理案件，并作出实体判决。这种情况下，不按撤诉处理也是合法的，因为它符合诉讼程序公正和效率的原则。

三、具体案例分析

以您提到的案例为例，如果原告（或上诉人）在一审（或二审）开庭时迟到了三个多小时，但法院认为这种迟到并未对被告的实体权利和诉讼权利造成实质性损害，且被告在原审程序中未对此提出异议，那么法院在各方当事人均到庭后再进行庭审的做法并无不当。此时，法院不会因原告（或上诉人）的迟到而按撤诉处理。

四、建议与注意事项

1. 及时到庭：无论是原告还是被告，无论是上诉还是应诉，都应尽量按时到庭，以维护自己的诉讼权利和避免不必要的法律风险。
2. 提出异议：如果对对方当事人的迟到行为有异议，应及时在庭审过程中提出，以便法院能够及时作出处理。
3. 咨询专业律师：在涉及法律问题时，尤其是诉讼程序问题，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细、更专业的法律建议。