检察院起诉后被告人不认罪，法院仍会依法进行审理并作出公正判决。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法院审理原则

1. 以事实为根据，以法律为准绳：法院在审理案件时，不会单纯依据被告是否认罪来定罪。而是会全面审查检察院提供的证据，包括物证、书证、证人证言、鉴定意见等，确保这些证据真实、充分，并能确凿证明被告有罪。
2. 证据充分性原则：只要检察院提供的证据确实、充分，能够排除合理怀疑地证明被告有罪，即使被告不承认，法院也可以作出有罪判决。例如，在盗窃案件中，如果监控视频清晰、证人证言可信且相互印证，符合证据充分的条件，法院可认定被告有罪。

二、被告人不认罪的影响

1. 不影响庭审正常进行：被告人不认罪并不会导致庭审无法进行。庭审过程中，检察院会出示相关证据，被告人及其辩护人也有权进行质证和辩论。法院会综合全案证据和事实，作出公正判决。
2. 可能增加辩护难度：对于被告人而言，不认罪可能会增加辩护的难度。因为法院在定罪时，会重点审查检察院提供的证据。如果被告人无法提供有效的反驳证据或理由，法院可能会更倾向于采纳检察院的证据和观点。

三、法律建议

1. 积极配合辩护：如果被告人不认罪，应当积极配合辩护律师的工作，提供可能的反驳证据或理由。辩护律师会根据案件情况，制定合适的辩护策略，以维护被告人的合法权益。
2. 尊重法院判决：无论被告人是否认罪，都应当尊重法院的判决。如果对判决结果有异议，可以在法定期限内提出上诉或申请再审。但在此之前，应当遵守法院的判决，履行相应的法律义务。

四、可能的法律后果

1. 有罪判决：如果检察院提供的证据确实、充分，能够证明被告有罪，即使被告不认罪，法院也会作出有罪判决。被告人将面临相应的刑事处罚。
2. 无罪判决：如果检察院提供的证据不足或存在瑕疵，无法证明被告有罪，或者被告人能够提供有效的反驳证据或理由，法院可能会作出无罪判决。被告人将不会被追究刑事责任。

举例说明：

假设某案件中，检察院以盗窃罪起诉被告人。庭审中，被告人坚称自己无罪，不承认指控的盗窃行为。但检察院出示了现场监控视频、证人证言等证据，证明被告人在案发时间出现在盗窃现场且有可疑举动。被告人虽然反驳称监控视频不能直接证明他实施了盗窃，证人证言也可能存在误差，但法院经过审查认为，这些证据相互印证，符合证据充分的条件。因此，法院最终作出了有罪判决。

总结与建议：

检察院起诉后被告人不认罪，并不会影响法院的依法审理和公正判决。被告人应当积极配合辩护律师的工作，提供可能的反驳证据或理由。同时，也应当尊重法院的判决，履行相应的法律义务。如果有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。