不能直接追加被执行人100%持股的公司为被执行人，并直接执行公司财产。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与原则
根据我国现行法律，并未规定被执行人作为公司股东时，在一定情形下可以追加其持股公司为被执行人。在执行程序中，变更、追加当事人需严格遵循法定主义原则，即必须有明确的法律依据才能进行。因此，人民法院不应直接追加被执行人持股100%股份的公司为被执行人。
二、具体情形分析
一人有限责任公司情形：
- 根据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》第二十条，若被执行人为一人有限责任公司，且股东不能证明公司财产独立于自己财产的，可以追加其股东为被执行人。
- 但此规定并未反向适用，即被执行人作为股东时，不能直接追加其持股公司为被执行人。
财产混同与恶意转移财产：
- 若申请执行人主张被执行人与持股公司存在财产混同、恶意转移财产以规避执行，这应通过其他诉讼程序（如股东损害公司债权人利益责任纠纷之诉）另行救济。
- 在未有生效法律文书确认持股公司应承担清偿责任的情况下，执行法院不得在执行程序中直接认定财产混同并裁定执行持股公司财产。
三、执行措施与程序边界
- 执行法院有权根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对被执行人的财产采取执行措施，如查询、扣押、冻结、划拨、变价等。
- 但这些措施应针对被执行人自身的财产，而非其持股公司的财产，除非有明确的法律依据支持。
四、建议与后续行动
若认为持股公司应承担责任：
- 应通过诉讼程序（如股东损害公司债权人利益责任纠纷之诉）来确认持股公司的责任。
- 获得生效法律文书后，再申请执行持股公司的财产。
若仅针对被执行人个人：
- 应继续执行被执行人个人的财产，包括其持有的其他公司股权（若符合执行条件）。
- 注意执行程序的合法性与边界，避免超越审判程序与执行程序的审查范围。
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