关于三年后下的征收批文是否可以诉协议无效的问题，结论是：这取决于多种因素，包括协议签订时的具体情况、是否存在法定无效情形以及诉讼时效等，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议无效的法定情形

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同（包括征收补偿协议）在以下情形下可能被认定为无效：

1. 无民事行为能力人实施的民事法律行为：如果签订协议的一方是无民事行为能力人（如未成年人或精神病人），则该协议可能无效。
2. 行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为：即双方签订协议时并非真实意思表示，而是出于其他目的（如逃避债务、骗取补偿等）。
3. 违反法律、行政法规的强制性规定：如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，如未经法定程序进行征收、补偿标准低于法定标准等，则该协议可能无效。
4. 违背公序良俗：如果协议内容违背了社会公共利益或道德准则，如通过不正当手段获取补偿等，则该协议可能无效。
5. 行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益：如果双方签订协议时存在恶意串通，损害国家、集体或第三人利益的情况，则该协议可能无效。

二、诉讼时效的考虑

即使协议存在上述无效情形，您还需要考虑诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果自您知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起超过三年，您可能丧失胜诉权。然而，也存在一些特殊情况，如自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

三、征收批文下发时间与协议无效的关系

征收批文下发的时间本身并不直接决定协议是否无效。关键在于协议签订时是否存在上述无效情形，以及您是否在诉讼时效期间内提起诉讼。如果征收批文下发后，您才发现协议存在无效情形，并且该情形在签订协议时就已经存在，那么您仍然有可能在诉讼时效期间内提起诉讼，要求确认协议无效。

四、建议与行动

1. 收集证据：如果您认为协议存在无效情形，首先需要收集相关证据，如协议文本、征收批文、相关法律法规等。
2. 咨询专业律师：由于协议无效的认定涉及复杂的法律问题和事实认定，建议您咨询专业律师，以便更准确地评估您的案件情况和胜诉可能性。
3. 及时提起诉讼：如果您决定提起诉讼，请确保在诉讼时效期间内进行，以免丧失胜诉权。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细、更专业的法律建议。