若检察院因事实不清、证据不足而结案，具体处理方式需根据案件所处的诉讼阶段来确定。以下是从不同诉讼阶段出发的详细分析：
一、审查起诉阶段
退回补充侦查：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院在审查起诉时，若认为案件证据不足、事实不清，可以退回公安机关补充侦查。
- 补充侦查的期限为一个月，且以二次为限。即，检察院最多可以两次退回公安机关进行补充侦查。
自行侦查：
- 除了退回公安机关补充侦查外，检察院也有权自行进行侦查，以收集更多证据，查明案件事实。
作出不起诉决定：
- 若经过两次补充侦查后，检察院仍然认为证据不足、不符合起诉条件，那么应当作出不起诉的决定。
- 不起诉决定意味着检察院认为现有证据不足以支持对犯罪嫌疑人的指控，因此决定不向法院提起公诉。
二、审判阶段（若案件已进入审判程序）
- 法院的无罪判决：
- 若案件已进入审判阶段，且法院在审理过程中认为检察院指控的证据不足、事实不清，不能认定被告人有罪，那么法院应当依法作出无罪判决。
- 无罪判决是法院对被告人无罪的正式认定，意味着被告人不承担刑事责任。
三、被害人权益保护
申诉权利：
- 若被害人对检察院的不起诉决定不服，可以在收到决定书之日起七日内向上一级检察院申诉。
- 申诉是被害人对检察院决定不满时的一种救济途径，通过申诉，被害人可以请求上一级检察院对案件进行重新审查。
直接起诉权利：
- 除了申诉外，被害人也有权直接向法院起诉。这是被害人自主行使诉讼权利的一种方式，通过直接起诉，被害人可以寻求法院对案件的公正裁决。
举例说明：
假设某案件中，犯罪嫌疑人因涉嫌盗窃罪被公安机关移送检察院审查起诉。检察院在审查过程中认为证据不足、事实不清，于是决定退回公安机关补充侦查。经过一个月的补充侦查后，公安机关再次移送案件。但检察院仍认为证据不够充分，于是又自行侦查了一个月。之后，检察院再次退回公安机关补充侦查。经过一个月的补充侦查完毕再次移送后，检察院审查后依旧认为证据不足、不符合起诉条件，遂作出不起诉决定。此时，若被害人对该决定不服，可以在收到决定书七日内向上一级检察院申诉，或者直接向法院起诉。
特别提醒：在整个诉讼过程中，无论是公安机关、检察院还是法院，都需要严格遵循法定程序和证据规则来处理案件。若您遇到类似情况，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。