法人持股的分配主要依据公司章程、股东协议以及相关法律法规进行。具体来说：

一. 依据公司章程和股东协议

1. 公司章程：公司章程是公司的基本法律文件，其中通常会明确规定股东的出资方式、出资额、持股比例以及股权的分配方式。因此，法人持股的分配首先应遵循公司章程的规定。
2. 股东协议：如果股东之间签订了股东协议，该协议也可能对股权的分配、转让、表决权等事项作出特别约定。在分配法人持股时，同样需要遵守股东协议的相关条款。

二. 遵循相关法律法规

1. 《公司法》：根据《公司法》的相关规定，股东按照实缴的出资比例分取红利；公司新增资本时，股东有权优先按照实缴的出资比例认缴出资。但是，全体股东约定不按照出资比例分取红利或者不按照出资比例优先认缴出资的除外。因此，在分配法人持股时，还需要考虑《公司法》的这些规定。

三. 实际操作中的考虑因素

1. 公司的实际运营情况：公司的实际运营情况，如盈利状况、发展前景等，也会影响法人持股的分配。例如，如果公司处于快速发展阶段，可能需要更多的资金投入，此时法人持股的分配可能会更倾向于那些能够提供更多资金支持的股东。
2. 股东的贡献和地位：股东在公司中的贡献和地位也是分配法人持股时需要考虑的因素。那些对公司发展做出重大贡献或者在公司中具有重要地位的股东，可能会获得更多的股权分配。

我建议，在分配法人持股时，应首先查阅公司章程和股东协议，明确股权分配的相关规定；同时，也需要考虑《公司法》的相关要求以及公司的实际运营情况和股东的贡献地位。如有进一步需要，您可以继续咨询我。