公交车在停靠站点合法停车时被追尾，责任主要由后车承担。这一结论是基于《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条的规定，即机动车之间发生交通事故的，由有过错的一方承担赔偿责任。以下是对此问题的详细分析：

一. 公交车合法停车的情况

在公交车站点停车，是公交车执行运输任务时的正常行为。根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第六十三条的规定，公共汽车在站点可以停车上下乘客。如果公交车在停靠站点时完全合规，未违反任何交通法规，那么在此情况下发生追尾事故，责任通常不在公交车一方。

• 例如，公交车在站点内规范停车，等待乘客上下车，此时后方车辆因未保持安全距离或驾驶不当而撞上公交车，责任应由后车承担。

二. 后车责任的分析

1. 未保持安全距离：在道路上行驶，后车应当与前车保持足以采取紧急制动措施的安全距离。如果后车未能做到这一点，导致追尾事故发生，那么后车应承担主要或全部责任。

2. 驾驶不当：后车驾驶员在行驶过程中，如果存在分心驾驶、超速、酒驾等违法行为，导致无法及时避让前方停放的公交车，也应承担相应责任。

三. 公交车责任的分析

尽管在大多数情况下，公交车在停靠站点停车时被追尾，责任应由后车承担，但也存在一些特殊情况：

1. 公交车违章停车：如果公交车未在规定的停车区域内停车，而是违章停靠在不允许停车的路段，且该违章行为与追尾事故的发生有因果关系，那么公交车也可能需要承担一定的责任。然而，这种情况较为少见，因为公交车通常会严格遵守停靠站点的规定。

2. 公交车未按规定警示：如果公交车在道路上停车后，未按规定开启危险报警闪光灯和设置警示标志，导致后车无法及时发现并避让，那么公交车也可能需要承担事故的次要责任。但根据问题描述，公交车是在停靠站点停车，此时并不需要额外开启危险报警闪光灯和设置警示标志。

总结：

• 在公交车合法停靠站点停车的情况下，如果发生追尾事故，责任主要由后车承担。
• 后车驾驶员应确保与前车保持安全距离，并遵守交通规则，以避免此类事故的发生。
• 公交车也应严格遵守停靠站点的规定，确保乘客上下车的安全。

我建议：在发生此类事故后，双方应立即停车并保护现场，如有人员伤亡应立即报警并抢救受伤人员。事故责任的具体划分应由交通警察根据现场情况和相关法律法规进行认定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。