您好，关于营运车辆按照非营运车投保后的赔偿问题，这是一个涉及保险法规定和保险合同条款的重要问题。下面我将结合相关法律法规和实际案例，为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，营运车辆按照非营运车投保，属于擅自改变车辆使用性质的行为。根据《中华人民共和国保险法》第五十二条的规定，在合同有效期内，如果保险标的（即被保险车辆）的危险程度显著增加，被保险人应当按照合同约定及时通知保险人。这里的“危险程度显著增加”，通常包括保险标的用途的改变、使用范围的改变等因素。对于营运车辆而言，其使用频率、行驶里程以及面临的风险都显著高于非营运车辆，因此，将营运车辆按照非营运车投保，无疑增加了保险标的的危险程度。
如果被保险人未履行通知义务，因保险标的危险程度显著增加而发生的保险事故，保险人不承担赔偿保险金的责任。这意味着，如果营运车辆在按照非营运车投保后发生事故，且该事故是由于车辆营运性质导致的危险程度增加而引发的，那么保险公司有权拒绝赔偿商业险部分的损失。
接下来，我通过一个实际案例来进一步说明这个问题。在某起机动车交通事故责任纠纷案中，一辆以“非营运”性质投保的货车在运输货物过程中发生事故，造成他人受伤。经查明，该货车实际上多次从事货物运输工作并收取报酬，属于营运车辆。法院审理认为，保险公司通过在线投保形式对相关免责条款进行了提示和明确说明，且投保人签字确认，应认定保险条款中的免责条款产生效力。因此，保险公司不承担商业三者险的赔偿责任，只需在交强险限额内承担赔偿责任，超出交强险限额部分由侵权人赔偿。
为了避免类似情况的发生，我建议您：
务必按照车辆实际使用性质投保相应的商业险。如果您的车辆是营运车辆，那么请务必选择营运性质的商业险进行投保，以确保在发生事故时能够得到充分的赔偿。
在投保时仔细阅读保险合同中的免责条款。了解哪些情况下保险公司不承担赔偿责任，以便在发生事故时能够明确自己的权益和责任。
如果车辆使用性质发生变化（如从非营运变为营运），请及时通知保险公司并调整保险种类。这样可以确保您的保险合同始终与车辆的实际使用性质相匹配，避免出现拒赔的情况。
综上所述，营运车辆按照非营运车投保后发生事故，保险公司有权拒绝赔偿商业险部分的损失。因此，我建议您务必按照车辆实际使用性质投保相应的商业险，并仔细阅读保险合同中的免责条款，以确保自己的权益得到充分保障。