面对公司不配合变更法人代表的情况，您可以依法采取以下措施来维护自身权益：
一、依法启动变更程序
召集股东大会：
- 根据《中华人民共和国公司法》及公司章程的规定，召集股东大会，讨论并确定新的法定代表人。这是变更法人代表的首要步骤，也是确保变更程序合法性的基础。
- 在股东大会上，应详细阐述变更法人代表的原因、必要性及新任法人代表的资质和条件，以获得股东们的理解和支持。
形成股东会决议：
- 股东会决议是变更法人代表的法定依据。在股东大会上，应形成关于变更法人代表的决议，并确保该决议获得法定多数决通过（通常为三分之二以上具有表决权的股东支持）。
- 股东会决议应明确新任法人代表的姓名、职务及任期等关键信息，并由全体股东签字确认。
二、向商业监督管理部门提交变更申请
准备变更材料：
- 根据商业监督管理部门的要求，准备变更法人代表所需的全部材料，包括但不限于《公司变更(备案)登记申请书》、新任法人代表的任命文件、原法人代表的离职证明等。
- 确保所有材料的真实性和合法性，避免因材料问题导致变更程序受阻。
提交变更申请：
- 将准备好的变更材料提交至当地的商业监督管理部门（工商局），并按照要求缴纳相关费用。
- 提交申请后，应密切关注变更程序的进展情况，及时与商业监督管理部门沟通，确保变更程序顺利进行。
三、应对公司不配合的法律后果
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司未在规定时间内完成变更登记的，公司登记机关有权对该公司处以最高达10万元人民币的罚款。
- 因此，如果公司不配合变更法人代表，您有权向公司登记机关举报，要求其对公司的违法行为进行处罚。
司法途径：
- 如果通过股东大会决议和向商业监督管理部门提交变更申请等方式仍无法解决问题，您可以考虑通过司法途径来维护自身权益。
- 具体而言，您可以向法院提起诉讼，要求法院判决公司履行变更法人代表的义务。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张，如股东会决议、变更申请材料等。
四、其他建议
友好协商：
- 在采取法律手段之前，您可以尝试与公司进行友好协商，了解公司不配合变更法人代表的具体原因，并寻求双方都能接受的解决方案。
- 友好协商有助于维护公司的稳定运营和股东之间的关系，避免因法律纠纷而给公司带来不必要的损失。
寻求专业帮助：
- 如果您对变更法人代表的程序和法律后果不太了解，或者遇到复杂的法律问题，建议您寻求专业律师的帮助。
- 专业律师能够为您提供全面的法律咨询和代理服务，帮助您顺利完成法人代表的变更程序。
面对公司不配合变更法人代表的情况，您应依法行事，通过召集股东大会、形成股东会决议、向商业监督管理部门提交变更申请等方式来维护自身权益。同时，您也可以考虑通过司法途径来解决问题。在整个过程中，建议您保持冷静和理性，寻求专业帮助以确保变更程序的顺利进行。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。