内部施工合作协议在满足一定条件下是具有法律效力的。以下是对这一问题的详细分析：

有效情形

1. 内容合法：内部施工合作协议的内容不能违反法律法规的强制性规定。例如，不能约定违反市场公平竞争原则、税收征管规定或工程建设法定程序、质量安全要求等内容。

2. 真实意思表示：协议必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情况。这意味着双方在签订协议时，都应处于自愿、平等和公平的地位。

3. 形式符合法律要求：对于需要书面形式的协议，如内部施工合作协议，就不能仅口头约定。书面形式可以包括合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，也视为书面形式。

4. 明确关键要素：协议应明确双方的权利和义务，清晰界定各自负责的事项；承包范围需具体明确边界；承包期限也要有明确起止时间等。这些关键要素的明确，有助于减少协议履行过程中的争议和纠纷。

无效情形

1. 承包人无资质或超越资质等级：若承包人不具备相应施工资质，或超越自身资质等级承接工程，协议可能无效。这是因为施工资质是确保工程质量的重要保障，无资质或超越资质等级的承包人可能无法胜任工程任务，从而损害发包人的利益。

2. 非法转包或违法分包：将工程整体转包给他人，或违法分包（如将主体结构工程分包等），违反法律规定，此类协议无效。这是因为转包和违法分包可能导致工程质量下降、工期延误等问题，损害发包人的利益。

3. 以合法形式掩盖非法目的：若签订协议是为了逃避法律责任或谋取非法利益，协议无效。例如，表面是内部施工合作，实际是为了逃避债务或进行其他非法活动。

4. 损害国家、集体或第三人利益：比如损害公共安全、环境等利益，协议也可能无效。这是因为内部施工合作协议不仅涉及双方当事人的利益，还可能涉及国家、集体或第三人的利益。如果协议损害了这些利益，就可能被认定为无效。

法律建议

1. 在签订内部施工合作协议前，务必对承包人的资质进行审查，确保其具备相应施工资质和等级。

2. 协议内容应明确、具体，避免使用模糊、歧义的表述。同时，协议应明确双方的权利和义务、承包范围、承包期限等关键要素。

3. 在协议履行过程中，双方应严格遵守协议约定，确保工程质量和工期。如果发生争议或纠纷，应及时协商解决或寻求法律途径解决。

4. 如果内部施工合作协议被认定无效，双方应按过错承担相应责任，如返还财产、折价补偿等。因此，在签订协议前，双方应充分评估协议的法律风险和后果。

如果您在内部施工合作协议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。